RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.16□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.15□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.15□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.15□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 NSD2O96028 1365 aa8.15□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.15□□□□□ -1.1
CCR6-201ENST00000341935 NLRP13Q86W25 1043 aa8.15□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.15□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.14□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R1AP30153 589 aa8.14□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 NUTM2FA1L443 756 aa8.13□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.13□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 MORC1Q86VD1 984 aa8.13□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.12□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 ACEP12821 1306 aa8.12□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 FYB1O15117 783 aa8.11□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.11□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 USP6P35125 1406 aa8.11□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 FGD1P98174 961 aa8.1□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.1□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 TMEM94Q12767 1356 aa8.1□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.1□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 SSH2Q76I76 1423 aa8.09□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 DCCP43146 1447 aa8.09□□□□□ -1.11
CCR6-201ENST00000341935 KIF1AQ12756 1690 aa8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 SHPRHQ149N8 1683 aa8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 NME9Q86XW9 330 aa8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 PIK3C2AO00443 1686 aa8.08□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.07□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.07□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.07□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.07□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 MST1RQ04912 1400 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 INSRP06213 1382 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 COG3Q96JB2 828 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 MSH6P52701 1360 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 ATF3P18847 181 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 MTHFSP49914 203 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.06□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 CFAP53Q96M91 514 aa8.05□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 ORAI2Q96SN7 254 aa8.05□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.05□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.04□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 USP31Q70CQ4 1352 aa8.04□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.04□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.03□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 PSME1Q06323 249 aa8.03□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 POLKQ9UBT6 870 aa8.03□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.02□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 FBLN1P23142 703 aa8.02□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 CFAP44Q96MT7 982 aa8.02□□□□□ -1.12
CCR6-201ENST00000341935 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 PEAK1Q9H792 1746 aa8.02□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.02□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.01□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 ALS2Q96Q42 1657 aa8.01□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 FOXO3O43524 673 aa8.01□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 ABTB2Q8N961 1025 aa8.01□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.01□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 NLRP6P59044 892 aa8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8□□□□□ -1.13
CCR6-201ENST00000341935 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms