RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.8■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.79■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 EID1Q9Y6B2 187 aa29.78■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 SLIT1O75093 1534 aa29.77■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 FBLN1P23142 703 aa29.76■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.76■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.76■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.76■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 POLKQ9UBT6 870 aa29.76■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 NME9Q86XW9 330 aa29.75■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.74■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 PTPRUQ92729 1446 aa29.73■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.72■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 AKAP12Q02952 1782 aa29.71■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.71■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 ITSN1Q15811 1721 aa29.7■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.69■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.66■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.66■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 TBX22Q9Y458 520 aa29.65■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 COG3Q96JB2 828 aa29.65■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.65■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.65■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 FCHSD2O94868 740 aa29.64■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 PDE3AQ14432 1141 aa29.64■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.64■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.63■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 MSH5O43196 834 aa29.62■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 NUTM2FA1L443 756 aa29.61■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 RIPK4P57078 832 aa29.61■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.61■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 ACEP12821 1306 aa29.59■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.59■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 PTCH1Q13635 1447 aa29.58■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 DIP2AQ14689 1571 aa29.58■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 PRKAR2BP31323 418 aa29.58■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.58■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 IL13P35225 146 aa29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 SKAP1Q86WV1 359 aa29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 PANK1Q8TE04 598 aa29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 MS4A1P11836 297 aa29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 IL16Q14005 1332 aa29.56■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.56■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.56■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 HMOX1P09601 288 aa29.54■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 COG6Q9Y2V7 657 aa29.54■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 USP6P35125 1406 aa29.53■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 NEFMP07197 916 aa29.52■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 PDE4AP27815 886 aa29.49■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 TNNQ9UQP3 1299 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 RLBP1P12271 317 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 NFE2L2Q16236 605 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 SSH2Q76I76 1423 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 BACH2Q9BYV9 841 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.44■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 KCNA6P17658 529 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 IGHDP01880 384 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 PIK3R4Q99570 1358 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.4■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.4■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 USP31Q70CQ4 1352 aa29.39■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 AAMPQ13685 434 aa29.38■■■□□ 2.29
SNX18-201ENST00000326277 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.38■■■□□ 2.29
SNX18-201ENST00000326277 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
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