RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.81■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.8■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.79■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 EID1Q9Y6B2 187 aa29.78■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 SLIT1O75093 1534 aa29.77■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 FBLN1P23142 703 aa29.76■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.76■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.76■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.76■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 POLKQ9UBT6 870 aa29.76■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 NME9Q86XW9 330 aa29.75■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.74■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 PTPRUQ92729 1446 aa29.73■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.72■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 AKAP12Q02952 1782 aa29.71■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.71■■■□□ 2.35
SNX18-201ENST00000326277 ITSN1Q15811 1721 aa29.7■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.69■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 KDM2BQ8NHM5 1336 aa29.66■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.66■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 TBX22Q9Y458 520 aa29.65■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 COG3Q96JB2 828 aa29.65■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.65■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.65■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 FCHSD2O94868 740 aa29.64■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 PDE3AQ14432 1141 aa29.64■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.64■■■□□ 2.34
SNX18-201ENST00000326277 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.63■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 MSH5O43196 834 aa29.62■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 NUTM2FA1L443 756 aa29.61■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 RIPK4P57078 832 aa29.61■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.61■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 ACEP12821 1306 aa29.59■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.59■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 PTCH1Q13635 1447 aa29.58■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 DIP2AQ14689 1571 aa29.58■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 PRKAR2BP31323 418 aa29.58■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.58■■■□□ 2.33
SNX18-201ENST00000326277 IL13P35225 146 aa29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 SKAP1Q86WV1 359 aa29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 PANK1Q8TE04 598 aa29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 MS4A1P11836 297 aa29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 IL16Q14005 1332 aa29.56■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.56■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.56■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 HMOX1P09601 288 aa29.54■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 COG6Q9Y2V7 657 aa29.54■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 USP6P35125 1406 aa29.53■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 NEFMP07197 916 aa29.52■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SNX18-201ENST00000326277 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.51■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 PDE4AP27815 886 aa29.49■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 TNNQ9UQP3 1299 aa29.48■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 RLBP1P12271 317 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 NFE2L2Q16236 605 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.47■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 SSH2Q76I76 1423 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 BACH2Q9BYV9 841 aa29.46■■■□□ 2.31
SNX18-201ENST00000326277 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.44■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 KCNA6P17658 529 aa29.43■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 IGHDP01880 384 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.42■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 PIK3R4Q99570 1358 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.41■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.4■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.4■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 USP31Q70CQ4 1352 aa29.39■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SNX18-201ENST00000326277 AAMPQ13685 434 aa29.38■■■□□ 2.29
SNX18-201ENST00000326277 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.38■■■□□ 2.29
SNX18-201ENST00000326277 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms