RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 NECTIN2Q92692 538 aa18.32■□□□□ 0.52
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LRRN1-201ENST00000319331 FBLN1P23142 703 aa18.31■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.31■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 EVC2Q86UK5 1308 aa18.31■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 REC8O95072 547 aa18.31■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.31■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.31■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC27Q2M243 656 aa18.31■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.3■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.3■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 SPC24Q8NBT2 197 aa18.3■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF592Q92610 1267 aa18.29■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 NUTM2FA1L443 756 aa18.28■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 CFAP44Q96MT7 982 aa18.28■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 GCC1Q96CN9 775 aa18.28■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.27■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 OFD1O75665 1012 aa18.27■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 TSC1Q92574 1164 aa18.27■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 TSPY26PQ9H489 355 aa18.27■□□□□ 0.52
LRRN1-201ENST00000319331 PHF14O94880 888 aa18.27■□□□□ 0.51
LRRN1-201ENST00000319331 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.26■□□□□ 0.51
LRRN1-201ENST00000319331 SMC5Q8IY18 1101 aa18.26■□□□□ 0.51
LRRN1-201ENST00000319331 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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LRRN1-201ENST00000319331 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
LRRN1-201ENST00000319331 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
LRRN1-201ENST00000319331 A2MP01023 1474 aa18.25■□□□□ 0.51
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LRRN1-201ENST00000319331 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
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LRRN1-201ENST00000319331 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
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LRRN1-201ENST00000319331 DCTN1Q14203 1278 aa18.23■□□□□ 0.51
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LRRN1-201ENST00000319331 MBD3O95983 291 aa18.21■□□□□ 0.51
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LRRN1-201ENST00000319331 C14orf37Q86TY3 774 aa18.21■□□□□ 0.51
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LRRN1-201ENST00000319331 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
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LRRN1-201ENST00000319331 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
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LRRN1-201ENST00000319331 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.18■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 NPHP1O15259 732 aa18.18■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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LRRN1-201ENST00000319331 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 CHD1O14646 1710 aa18.18■□□□□ 0.5
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LRRN1-201ENST00000319331 FBXW7Q969H0 707 aa18.16■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.16■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.16■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 ERC2O15083 957 aa18.16■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 TSPYL6Q8N831 410 aa18.16■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 STAC3Q96MF2 364 aa18.15■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.15■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 STK31Q9BXU1 1019 aa18.15■□□□□ 0.5
LRRN1-201ENST00000319331 KIF3AQ9Y496 699 aa18.14■□□□□ 0.49
LRRN1-201ENST00000319331 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.14■□□□□ 0.49
LRRN1-201ENST00000319331 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
LRRN1-201ENST00000319331 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.13■□□□□ 0.49
LRRN1-201ENST00000319331 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
LRRN1-201ENST00000319331 CABP1Q9NZU7 370 aa18.13■□□□□ 0.49
LRRN1-201ENST00000319331 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.13■□□□□ 0.49
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