RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317378.5

TRAPPC5-201, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-201ENST00000317378 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC5-201ENST00000317378 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.51■■■□□ 2.32
TRAPPC5-201ENST00000317378 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 BTG4Q9NY30 223 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 NRAPQ86VF7 1730 aa29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 ACEP12821 1306 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.47■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC5-201ENST00000317378 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.4■■■□□ 2.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 KIAA0232Q92628 1395 aa29.39■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 CABP2Q9NPB3 220 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.36■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 ABTB2Q8N961 1025 aa29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 CHRNA2Q15822 529 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 USP19O94966 1318 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.33■■■□□ 2.29
TRAPPC5-201ENST00000317378 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.32■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 A0A0G2JS52 829 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 MYT1Q01538 1121 aa29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 NEUROD1Q13562 356 aa29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 CPDO75976 1380 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 CABP1Q9NZU7 370 aa29.29■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 NLRP13Q86W25 1043 aa29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC5-201ENST00000317378 EVC2Q86UK5 1308 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 GCP02774 474 aa29.25■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 USP6P35125 1406 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 STRN4Q9NRL3 753 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 SSH2Q76I76 1423 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 BARGINQ6ZT62 677 aa29.21■■■□□ 2.27
TRAPPC5-201ENST00000317378 BAG6P46379 1132 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 EVA1CP58658 441 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 FAM182BQ5T319 152 aa29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 NLRP6P59044 892 aa29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 SLIT3O75094 1523 aa29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 USP35Q9P2H5 1018 aa29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.14■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 DISP2A7MBM2 1401 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 PIK3C2AO00443 1686 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC5-201ENST00000317378 AKAP12Q02952 1782 aa29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 PDE3BQ13370 1112 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 CRB1P82279 1406 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 COL18A1P39060 1754 aa29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 TRIM37O94972 964 aa29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 TONSLQ96HA7 1378 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 APBA3O96018 575 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC5-201ENST00000317378 LRP5O75197 1615 aa28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms