RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.84■■□□□ 1.57
ZNF554-201ENST00000317243 RLBP1P12271 317 aa24.83■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.83■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.82■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.81■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.81■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.81■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.8■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.79■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 NLRP1Q9C000 1473 aa24.78■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.78■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 METP08581 1390 aa24.77■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 ARXQ96QS3 562 aa24.77■■□□□ 1.56
ZNF554-201ENST00000317243 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.76■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.76■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 NSD2O96028 1365 aa24.75■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 NUTM2FA1L443 756 aa24.73■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.73■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 SEC24BO95487 1268 aa24.71■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 WDR63Q8IWG1 891 aa24.71■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 ZMYM3Q14202 1370 aa24.71■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 NME9Q86XW9 330 aa24.71■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.7■■□□□ 1.55
ZNF554-201ENST00000317243 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.7■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 HMOX1P09601 288 aa24.7■■□□□ 1.54
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ZNF554-201ENST00000317243 NGEFQ8N5V2 710 aa24.7■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.7■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 AGLP35573 1532 aa24.69■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.69■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 USP19O94966 1318 aa24.68■■□□□ 1.54
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ZNF554-201ENST00000317243 POLKQ9UBT6 870 aa24.68■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 PDE3AQ14432 1141 aa24.67■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.67■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 RIPK4P57078 832 aa24.67■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.67■■□□□ 1.54
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ZNF554-201ENST00000317243 CCDC27Q2M243 656 aa24.66■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.66■■□□□ 1.54
ZNF554-201ENST00000317243 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.66■■□□□ 1.54
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ZNF554-201ENST00000317243 ADGRB2O60241 1585 aa24.65■■□□□ 1.54
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ZNF554-201ENST00000317243 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.6■■□□□ 1.53
ZNF554-201ENST00000317243 BECN1Q14457 450 aa24.59■■□□□ 1.53
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ZNF554-201ENST00000317243 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.57■■□□□ 1.52
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ZNF554-201ENST00000317243 PANK2Q9BZ23 570 aa24.57■■□□□ 1.52
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ZNF554-201ENST00000317243 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.54■■□□□ 1.52
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ZNF554-201ENST00000317243 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.53■■□□□ 1.52
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ZNF554-201ENST00000317243 DLC1Q96QB1 1528 aa24.53■■□□□ 1.52
ZNF554-201ENST00000317243 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ZNF554-201ENST00000317243 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.52■■□□□ 1.52
ZNF554-201ENST00000317243 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ZNF554-201ENST00000317243 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.51■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 FAM83GA6ND36 823 aa24.51■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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