RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 MTHFSP49914 203 aa21.79■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.79■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.78■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.78■■□□□ 1.08
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 ITSN1Q15811 1721 aa21.76■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.75■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.75■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 ORAI2Q96SN7 254 aa21.74■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 AKAP12Q02952 1782 aa21.74■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.74■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.73■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 TMEM94Q12767 1356 aa21.73■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.73■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.73■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 SOX12O15370 315 aa21.72■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 NSD2O96028 1365 aa21.72■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.72■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 NWD1Q149M9 1564 aa21.72■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.71■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.71■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.71■■□□□ 1.07
CHTF18-202ENST00000317063 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.7■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.7■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 USP6P35125 1406 aa21.7■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.69■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 COG3Q96JB2 828 aa21.68■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 FOXO3O43524 673 aa21.67■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.66■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.66■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.66■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 POLKQ9UBT6 870 aa21.65■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 ATF3P18847 181 aa21.64■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CHTF18-202ENST00000317063 PSME1Q06323 249 aa21.64■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.63■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 CFAP53Q96M91 514 aa21.62■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 SSH2Q76I76 1423 aa21.62■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.61■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 NLRP6P59044 892 aa21.61■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 ABTB2Q8N961 1025 aa21.61■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.057e-8■□□□□ 10.6
CHTF18-202ENST00000317063 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.58■■□□□ 1.05
CHTF18-202ENST00000317063 SHPRHQ149N8 1683 aa21.58■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.58■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 APAF1O14727 1248 aa21.57■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.56■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.56■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 MSH6P52701 1360 aa21.55■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 NEUROD2Q15784 382 aa21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 PIK3C2AO00443 1686 aa21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 MST1RQ04912 1400 aa21.54■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.53■■□□□ 1.04
CHTF18-202ENST00000317063 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.51■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 HMOX1P09601 288 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 NUDCQ9Y266 331 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 SLAIN2Q9P270 581 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 USP31Q70CQ4 1352 aa21.47■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.46■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 IL27Q8NEV9 243 aa21.46■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 IL13P35225 146 aa21.45■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 RUNDC1Q96C34 613 aa21.45■■□□□ 1.03
CHTF18-202ENST00000317063 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 BRINP3Q76B58 766 aa21.45■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 AMPHP49418 695 aa21.44■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 DCCP43146 1447 aa21.44■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 PEAK1Q9H792 1746 aa21.44■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 INSRP06213 1382 aa21.43■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.41■■□□□ 1.02
CHTF18-202ENST00000317063 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.41■■□□□ 1.02
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