RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 SMC5Q8IY18 1101 aa24.15■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 GBP4Q96PP9 640 aa24.15■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
MVB12A-201ENST00000317040 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.14■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 NPATQ14207 1427 aa24.14■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.14■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.14■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.13■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 TERF1P54274 439 aa24.13■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 USP32Q8NFA0 1604 aa24.13■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 MROH2AA6NES4 1674 aa24.13■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 ERBB4Q15303 1308 aa24.12■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.12■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 TET3O43151 1660 aa24.12■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 ARXQ96QS3 562 aa24.12■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 CLTCL1P53675 1640 aa24.11■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 MYOM2P54296 1465 aa24.1■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 C3P01024 1663 aa24.1■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.1■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.09■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.08■■□□□ 1.45
MVB12A-201ENST00000317040 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.07■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.07■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.07■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 ADGRB2O60241 1585 aa24.06■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.05■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.04■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.02■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.02■■□□□ 1.44
MVB12A-201ENST00000317040 NOS1P29475 1434 aa24.01■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 HS1BP3Q53T59 392 aa24.01■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 TNNQ9UQP3 1299 aa24.01■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 OFD1O75665 1012 aa24■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 MAP7D2Q96T17 732 aa24■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 KIF16BQ96L93 1317 aa24■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 TNRQ92752 1358 aa24■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.99■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 IFT172Q9UG01 1749 aa23.98■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.97■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.96■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 CFAP53Q96M91 514 aa23.96■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.96■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 MORC1Q86VD1 984 aa23.96■■□□□ 1.43
MVB12A-201ENST00000317040 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.95■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 IDI1Q13907 227 aa23.95■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.94■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.93■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.93■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.93■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 NUCB1Q02818 461 aa23.92■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 NSD2O96028 1365 aa23.92■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.92■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 NEUROD2Q15784 382 aa23.91■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.91■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 ABCC11Q96J66 1382 aa23.91■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.9■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 IL16Q14005 1332 aa23.9■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 KIF1BO60333 1816 aa23.9■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
MVB12A-201ENST00000317040 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF445P59923 1031 aa23.89■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 TRIM27P14373 513 aa23.88■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.88■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.87■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 KIF2CQ99661 725 aa23.86■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.84■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 PIK3C2BO00750 1634 aa23.84■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.84■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 CFAP44Q96MT7 982 aa23.84■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.83■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 MCM5P33992 734 aa23.83■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.83■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.83■■□□□ 1.41
MVB12A-201ENST00000317040 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.83■■□□□ 1.4
MVB12A-201ENST00000317040 MTHFSP49914 203 aa23.82■■□□□ 1.4
MVB12A-201ENST00000317040 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
MVB12A-201ENST00000317040 MED14O60244 1454 aa23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms