RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.99■■■□□ 2.39
STX4-201ENST00000313843 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
STX4-201ENST00000313843 SSH2Q76I76 1423 aa29.99■■■□□ 2.39
STX4-201ENST00000313843 PIK3C2AO00443 1686 aa29.98■■■□□ 2.39
STX4-201ENST00000313843 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
STX4-201ENST00000313843 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
STX4-201ENST00000313843 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.96■■■□□ 2.39
STX4-201ENST00000313843 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
STX4-201ENST00000313843 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 ANP32CO43423 234 aa29.94■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.94■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.94■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.94■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 ALS2Q96Q42 1657 aa29.92■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 PXDNQ92626 1479 aa29.92■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 USP54Q70EL1 1684 aa29.91■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 NSD2O96028 1365 aa29.9■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 NME9Q86XW9 330 aa29.89■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
STX4-201ENST00000313843 FYB1O15117 783 aa29.88■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.88■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.88■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.88■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 MIER1Q8N108 512 aa29.87■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 PHLPP1O60346 1717 aa29.87■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.86■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 SBNO1A3KN83 1393 aa29.84■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.83■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.83■■■□□ 2.37
STX4-201ENST00000313843 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.81■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 RALBP1Q15311 655 aa29.8■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 MORC1Q86VD1 984 aa29.8■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.8■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 ABTB2Q8N961 1025 aa29.8■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.79■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.78■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.78■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 USP31Q70CQ4 1352 aa29.78■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 COG3Q96JB2 828 aa29.77■■■□□ 2.36
STX4-201ENST00000313843 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 ARHGEF10O15013 1369 aa29.75■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 HSPA1LP34931 641 aa29.75■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 NLRP6P59044 892 aa29.74■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 ABCA3Q99758 1704 aa29.73■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 LTN1O94822 1766 aa29.71■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 NLRP13Q86W25 1043 aa29.71■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 PPP2R1AP30153 589 aa29.7■■■□□ 2.35
STX4-201ENST00000313843 SLIT3O75094 1523 aa29.7■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 PLEKHG5O94827 1062 aa29.67■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 FBLN1P23142 703 aa29.67■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 NFAT5O94916 1531 aa29.66■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 SOX12O15370 315 aa29.65■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.65■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 USP19O94966 1318 aa29.64■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 CCDC184Q52MB2 194 aa29.64■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 PEAK1Q9H792 1746 aa29.64■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
STX4-201ENST00000313843 JCADQ9P266 1359 aa29.63■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.62■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 SHPRHQ149N8 1683 aa29.62■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 CCER2I3L3R5 266 aa29.61■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.59■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.58■■■□□ 2.33
STX4-201ENST00000313843 MTHFSP49914 203 aa29.57■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 ILDR2Q71H61 639 aa29.57■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 MRS2Q9HD23 443 aa29.56■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 POLKQ9UBT6 870 aa29.56■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.56■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 GCP02774 474 aa29.55■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 RGPD5Q99666 1765 aa29.54■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.52■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
STX4-201ENST00000313843 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.5■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 COL18A1P39060 1754 aa29.48■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.47■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 SOCS7O14512 581 aa29.46■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 CFAP53Q96M91 514 aa29.45■■■□□ 2.31
STX4-201ENST00000313843 FLT4P35916 1363 aa29.45■■■□□ 2.3
STX4-201ENST00000313843 RTL1A6NKG5 1358 aa29.44■■■□□ 2.3
STX4-201ENST00000313843 AMPHP49418 695 aa29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms