RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.06■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.05■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 NEUROD1Q13562 356 aa22.05■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 ACEP12821 1306 aa22.04■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.04■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.02■■□□□ 1.12
CTSW-201ENST00000307886 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.02■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 NRAPQ86VF7 1730 aa22.01■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 CABP2Q9NPB3 220 aa22■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 BTG4Q9NY30 223 aa22■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.99■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.99■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.97■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.95■■□□□ 1.11
CTSW-201ENST00000307886 KIAA0232Q92628 1395 aa21.94■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 CHRNA2Q15822 529 aa21.93■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 CCDC125Q86Z20 511 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 CABP1Q9NZU7 370 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.91■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 ABTB2Q8N961 1025 aa21.9■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 USP19O94966 1318 aa21.9■■□□□ 1.1
CTSW-201ENST00000307886 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.88■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 SSH2Q76I76 1423 aa21.88■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.87■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 EVC2Q86UK5 1308 aa21.87■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 USP6P35125 1406 aa21.87■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.85■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 GCP02774 474 aa21.84■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.84■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 CPDO75976 1380 aa21.84■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.83■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.83■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.83■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 NLRP13Q86W25 1043 aa21.83■■□□□ 1.09
CTSW-201ENST00000307886 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 STRN4Q9NRL3 753 aa21.82■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 FAM182BQ5T319 152 aa21.81■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 A0A0G2JS52 829 aa21.8■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 MYT1Q01538 1121 aa21.8■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 NLRP6P59044 892 aa21.8■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 PIK3C2AO00443 1686 aa21.79■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.79■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.78■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 AKAP12Q02952 1782 aa21.78■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 SLIT3O75094 1523 aa21.78■■□□□ 1.08
CTSW-201ENST00000307886 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 TONSLQ96HA7 1378 aa21.76■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.76■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 EVA1CP58658 441 aa21.76■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.76■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 BARGINQ6ZT62 677 aa21.75■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 USP35Q9P2H5 1018 aa21.75■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 COL18A1P39060 1754 aa21.74■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.72■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.72■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.72■■□□□ 1.07
CTSW-201ENST00000307886 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.7■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.7■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.69■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.69■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 TESK2Q96S53 571 aa21.68■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.68■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.67■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.66■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 BAG6P46379 1132 aa21.66■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 RGPD5Q99666 1765 aa21.66■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 CRB1P82279 1406 aa21.65■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.65■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 NFAT5O94916 1531 aa21.65■■□□□ 1.06
CTSW-201ENST00000307886 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.64■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 TRIM37O94972 964 aa21.64■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 DISP2A7MBM2 1401 aa21.64■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 SOX12O15370 315 aa21.63■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.63■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 USP31Q70CQ4 1352 aa21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms