RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 JPH4Q96JJ6 628 aa18■□□□□ 0.47
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CCNDBP1-201ENST00000300213 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18■□□□□ 0.47
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PIK3C2GO75747 1445 aa17.97■□□□□ 0.47
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC24A1O60721 1099 aa17.95■□□□□ 0.46
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PDLIM2Q96JY6 352 aa17.88■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 BCL2L12Q9HB09 334 aa17.88■□□□□ 0.45
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.88■□□□□ 0.45
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC4A10Q6U841 1118 aa17.87■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.87■□□□□ 0.45
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PHF14O94880 888 aa17.86■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 E9PCH4 1651 aa17.86■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF710Q8N1W2 664 aa17.85■□□□□ 0.45
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ADGRL2O95490 1459 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLA2R1Q13018 1463 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMX3Q96JJ7 454 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP26Q9BXU7 913 aa17.84■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 SDSP20132 328 aa17.83■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNJ4P48050 445 aa17.83■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.83■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
CCNDBP1-201ENST00000300213 GIMAP6Q6P9H5 292 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRIMPOLQ96LW4 560 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZDHHC9Q9Y397 364 aa17.83■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRKAR2BP31323 418 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCNDBP1-201ENST00000300213 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
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