RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 CDK19Q9BWU1 502 aa22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 ALKQ9UM73 1620 aa22.77■■□□□ 1.24
TSPAN17-201ENST00000298564 PDE3AQ14432 1141 aa22.76■■□□□ 1.23
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TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC27Q2M243 656 aa22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17-201ENST00000298564 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TSPAN17-201ENST00000298564 CABP1Q9NZU7 370 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17-201ENST00000298564 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN17-201ENST00000298564 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.73■■□□□ 1.23
TSPAN17-201ENST00000298564 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.73■■□□□ 1.23
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TSPAN17-201ENST00000298564 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.69■■□□□ 1.22
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TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPAN17-201ENST00000298564 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.68■■□□□ 1.22
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TSPAN17-201ENST00000298564 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.67■■□□□ 1.22
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TSPAN17-201ENST00000298564 NLRP1Q9C000 1473 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPAN17-201ENST00000298564 REREQ9P2R6 1566 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPAN17-201ENST00000298564 BECN1Q14457 450 aa22.66■■□□□ 1.22
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TSPAN17-201ENST00000298564 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.64■■□□□ 1.22
TSPAN17-201ENST00000298564 PANK2Q9BZ23 570 aa22.64■■□□□ 1.22
TSPAN17-201ENST00000298564 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.64■■□□□ 1.22
TSPAN17-201ENST00000298564 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 MED14O60244 1454 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 ADGRB2O60241 1585 aa22.63■■□□□ 1.21
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TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.59■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 RIPK4P57078 832 aa22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.58■■□□□ 1.21
TSPAN17-201ENST00000298564 ZMYM3Q14202 1370 aa22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 DLC1Q96QB1 1528 aa22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 METP08581 1390 aa22.57■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 POLKQ9UBT6 870 aa22.56■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP7BP35670 1465 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TSPAN17-201ENST00000298564 AAMPQ13685 434 aa22.52■■□□□ 1.2
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TSPAN17-201ENST00000298564 NME9Q86XW9 330 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 PRKAR2BP31323 418 aa22.51■■□□□ 1.19
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TSPAN17-201ENST00000298564 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.5■■□□□ 1.19
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TSPAN17-201ENST00000298564 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 IL16Q14005 1332 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 HMOX1P09601 288 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 MCM4P33991 863 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM27P14373 513 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TSPAN17-201ENST00000298564 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 TNRQ92752 1358 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.44■■□□□ 1.18
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