RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 NGLY1Q96IV0 654 aa35.2■■■■□ 3.23
CXCL2-201ENST00000296031 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.2■■■■□ 3.23
CXCL2-201ENST00000296031 TESK2Q96S53 571 aa35.19■■■■□ 3.22
CXCL2-201ENST00000296031 SLC24A1O60721 1099 aa35.16■■■■□ 3.22
CXCL2-201ENST00000296031 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CXCL2-201ENST00000296031 AKAP12Q02952 1782 aa35.1■■■■□ 3.21
CXCL2-201ENST00000296031 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.1■■■■□ 3.21
CXCL2-201ENST00000296031 USP6P35125 1406 aa35.1■■■■□ 3.21
CXCL2-201ENST00000296031 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
CXCL2-201ENST00000296031 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.08■■■■□ 3.21
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CXCL2-201ENST00000296031 USP21Q9UK80 565 aa35.07■■■■□ 3.2
CXCL2-201ENST00000296031 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
CXCL2-201ENST00000296031 ABTB2Q8N961 1025 aa35.06■■■■□ 3.2
CXCL2-201ENST00000296031 TMC1Q8TDI8 760 aa35.06■■■■□ 3.2
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CXCL2-201ENST00000296031 TMF1P82094 1093 aa35.03■■■■□ 3.2
CXCL2-201ENST00000296031 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
CXCL2-201ENST00000296031 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
CXCL2-201ENST00000296031 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 MON2Q7Z3U7 1717 aa35■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 SSH2Q76I76 1423 aa34.99■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 RXRBP28702 533 aa34.99■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.98■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 SLIT2O94813 1529 aa34.98■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 NRKQ7Z2Y5 1582 aa34.98■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.97■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 SOCS7O14512 581 aa34.97■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 PIK3C2AO00443 1686 aa34.96■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 NLRP13Q86W25 1043 aa34.96■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.95■■■■□ 3.19
CXCL2-201ENST00000296031 FAM83GA6ND36 823 aa34.94■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.94■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 ATRNO75882 1429 aa34.94■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.94■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 USP19O94966 1318 aa34.93■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 CDCA8Q53HL2 280 aa34.93■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.93■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.92■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 NLRP6P59044 892 aa34.92■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.92■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.9■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.9■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 A0A1W2PP64 1363 aa34.89■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 KIAA0232Q92628 1395 aa34.89■■■■□ 3.18
CXCL2-201ENST00000296031 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.86■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 GCP02774 474 aa34.85■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 NRAPQ86VF7 1730 aa34.85■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 BTG4Q9NY30 223 aa34.85■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 SLIT3O75094 1523 aa34.84■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 CHRNA2Q15822 529 aa34.83■■■■□ 3.17
CXCL2-201ENST00000296031 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 RGS12O14924 1447 aa34.81■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 CPDO75976 1380 aa34.79■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa34.79■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 VPS72Q15906 364 aa34.78■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 NME9Q86XW9 330 aa34.78■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 MYOM1P52179 1685 aa34.78■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 ZRANB1Q9UGI0 708 aa34.77■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 GLI3P10071 1580 aa34.77■■■■□ 3.16
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.75■■■■□ 3.15
CXCL2-201ENST00000296031 USP54Q70EL1 1684 aa34.75■■■■□ 3.15
CXCL2-201ENST00000296031 SOX12O15370 315 aa34.74■■■■□ 3.15
CXCL2-201ENST00000296031 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.74■■■■□ 3.15
CXCL2-201ENST00000296031 USP31Q70CQ4 1352 aa34.74■■■■□ 3.15
CXCL2-201ENST00000296031 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.73■■■■□ 3.15
CXCL2-201ENST00000296031 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.72■■■■□ 3.15
CXCL2-201ENST00000296031 STRN4Q9NRL3 753 aa34.69■■■■□ 3.14
CXCL2-201ENST00000296031 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.69■■■■□ 3.14
CXCL2-201ENST00000296031 NFAT5O94916 1531 aa34.68■■■■□ 3.14
CXCL2-201ENST00000296031 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL2-201ENST00000296031 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL2-201ENST00000296031 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL2-201ENST00000296031 EVA1CP58658 441 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL2-201ENST00000296031 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL2-201ENST00000296031 COL18A1P39060 1754 aa34.63■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.62■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.62■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.6■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.6■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 COG3Q96JB2 828 aa34.59■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.58■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 LTN1O94822 1766 aa34.58■■■■□ 3.13
CXCL2-201ENST00000296031 RGPD5Q99666 1765 aa34.57■■■■□ 3.12
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