RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292408.8

FGFR4-201, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGFR4, Length 3,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-201ENST00000292408 SMC5Q8IY18 1101 aa20.57■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 PRAM1Q96QH2 718 aa20.57■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 A0A1W2PP64 1363 aa20.57■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 AAMPQ13685 434 aa20.56■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.56■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 FSD2A1L4K1 749 aa20.56■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.56■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 TET3O43151 1660 aa20.56■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 SHPRHQ149N8 1683 aa20.56■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.56■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 CABP1Q9NZU7 370 aa20.56■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 IDI1Q13907 227 aa20.54■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 NUCB1Q02818 461 aa20.53■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 MYOM2P54296 1465 aa20.53■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 MROH2AA6NES4 1674 aa20.53■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 NPATQ14207 1427 aa20.53■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 DCTN1Q14203 1278 aa20.53■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.52■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 SSFA2P28290 1259 aa20.52■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.52■□□□□ 0.88
FGFR4-201ENST00000292408 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 ERBB4Q15303 1308 aa20.51■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 FAM83GA6ND36 823 aa20.5■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 MRE11P49959 708 aa20.5■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.5■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.5■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.49■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 KIF1BO60333 1816 aa20.49■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.49■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.48■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 KIF16BQ96L93 1317 aa20.48■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.48■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.48■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.47■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 SHROOM2Q13796 1616 aa20.47■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 KIF2CQ99661 725 aa20.47■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.47■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 CDK19Q9BWU1 502 aa20.47■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.47■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 KRT24Q2M2I5 525 aa20.46■□□□□ 0.87
FGFR4-201ENST00000292408 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 SOX12O15370 315 aa20.45■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 GBP4Q96PP9 640 aa20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 ESPNB1AK53 854 aa20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.44■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 VAMP4O75379 141 aa20.43■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.43■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.43■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.43■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.43■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 DEPDC5O75140 1603 aa20.42■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 PKP1Q13835 747 aa20.42■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 MBIPQ9NS73 344 aa20.42■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 CLCN1P35523 988 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 POLKQ9UBT6 870 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 ASXL2Q76L83 1435 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 ADGRB1O14514 1584 aa20.41■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 MCTP1Q6DN14 999 aa20.4■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.4■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 NUTM2FA1L443 756 aa20.4■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.4■□□□□ 0.86
FGFR4-201ENST00000292408 NME9Q86XW9 330 aa20.39■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 ABCC11Q96J66 1382 aa20.38■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 DDIT3P35638 169 aa20.38■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 SNX21Q969T3 373 aa20.38■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FGFR4-201ENST00000292408 FCHSD2O94868 740 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms