RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 E9PSI1 815 aa24.82■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 WWC1Q8IX03 1113 aa24.82■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.81■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 PTCH1Q13635 1447 aa24.79■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.79■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.78■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC27Q2M243 656 aa24.77■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.77■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.77■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 NME9Q86XW9 330 aa24.77■■□□□ 1.56
GDPD1-201ENST00000284116 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.76■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 POLKQ9UBT6 870 aa24.76■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 PLIN1O60240 522 aa24.75■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 NEUROD2Q15784 382 aa24.75■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 WDR63Q8IWG1 891 aa24.75■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 PIK3R4Q99570 1358 aa24.74■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.74■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.72■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.72■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 FBLN1P23142 703 aa24.71■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 COG3Q96JB2 828 aa24.71■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 ACEP12821 1306 aa24.71■■□□□ 1.55
GDPD1-201ENST00000284116 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.7■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.69■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 NUTM2FA1L443 756 aa24.68■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.68■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 CRBNQ96SW2 442 aa24.66■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 KCNA6P17658 529 aa24.65■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 USP6P35125 1406 aa24.65■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 FCHSD2O94868 740 aa24.65■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.65■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.65■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
GDPD1-201ENST00000284116 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.63■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 SSH2Q76I76 1423 aa24.62■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 IL13P35225 146 aa24.61■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.6■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.6■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 BCAR3O75815 825 aa24.59■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.59■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.59■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.58■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.58■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.58■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
GDPD1-201ENST00000284116 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.57■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.57■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.57■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.56■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 RIPK4P57078 832 aa24.56■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 PRKAR2BP31323 418 aa24.55■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 IL16Q14005 1332 aa24.54■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 USP31Q70CQ4 1352 aa24.54■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 NEFMP07197 916 aa24.53■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 RARSP54136 660 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GDPD1-201ENST00000284116 HMOX1P09601 288 aa24.51■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 PDE3AQ14432 1141 aa24.49■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.49■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.48■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 NFE2L2Q16236 605 aa24.48■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 PEAK1Q9H792 1746 aa24.46■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GDPD1-201ENST00000284116 PIK3C2AO00443 1686 aa24.45■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.42■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.41■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.4■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 USP54Q70EL1 1684 aa24.4■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.4■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.39■■□□□ 1.5
GDPD1-201ENST00000284116 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.39■■□□□ 1.49
GDPD1-201ENST00000284116 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.39■■□□□ 1.49
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