RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.56■■□□□ 1.04
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COL5A3-201ENST00000264828 MPNDQ8N594 471 aa21.55■■□□□ 1.04
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COL5A3-201ENST00000264828 ZNF428Q96B54 188 aa21.49■■□□□ 1.03
COL5A3-201ENST00000264828 FAM177BA6PVY3 158 aa21.49■■□□□ 1.03
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COL5A3-201ENST00000264828 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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COL5A3-201ENST00000264828 MTHFSP49914 203 aa21.46■■□□□ 1.03
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COL5A3-201ENST00000264828 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.46■■□□□ 1.03
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COL5A3-201ENST00000264828 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.45■■□□□ 1.02
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COL5A3-201ENST00000264828 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
COL5A3-201ENST00000264828 KLHL34Q8N239 644 aa21.44■■□□□ 1.02
COL5A3-201ENST00000264828 SERPINC1P01008 464 aa21.44■■□□□ 1.02
COL5A3-201ENST00000264828 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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COL5A3-201ENST00000264828 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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COL5A3-201ENST00000264828 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
COL5A3-201ENST00000264828 CCP110O43303 1012 aa21.43■■□□□ 1.02
COL5A3-201ENST00000264828 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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COL5A3-201ENST00000264828 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.43■■□□□ 1.02
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COL5A3-201ENST00000264828 STAC3Q96MF2 364 aa21.43■■□□□ 1.02
COL5A3-201ENST00000264828 BCAR3O75815 825 aa21.42■■□□□ 1.02
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COL5A3-201ENST00000264828 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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COL5A3-201ENST00000264828 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.39■■□□□ 1.01
COL5A3-201ENST00000264828 PDCP20941 246 aa21.39■■□□□ 1.01
COL5A3-201ENST00000264828 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
COL5A3-201ENST00000264828 TXLNAP40222 546 aa21.39■■□□□ 1.01
COL5A3-201ENST00000264828 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.39■■□□□ 1.01
COL5A3-201ENST00000264828 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.38■■□□□ 1.01
COL5A3-201ENST00000264828 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.38■■□□□ 1.01
COL5A3-201ENST00000264828 UQCRHP07919 91 aa21.38■■□□□ 1.01
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC192P0DO97 292 aa21.38■■□□□ 1.01
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