RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 MYOM2P54296 1465 aa10.32□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.32□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.32□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRL2O95490 1459 aa10.31□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 ORAI2Q96SN7 254 aa10.31□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.31□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.3□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.29□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa10.28□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 PXDNQ92626 1479 aa10.28□□□□□ -0.76
SMARCE1-201ENST00000264640 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.27□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 USP32Q8NFA0 1604 aa10.26□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 IER5LQ5T953 404 aa10.26□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.26□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.26□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA3Q99758 1704 aa10.25□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF1BO60333 1816 aa10.25□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.25□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 CLTCL1P53675 1640 aa10.25□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 SLIT2O94813 1529 aa10.24□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP8Q14318 412 aa10.24□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNL1Q8IU54 200 aa10.24□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.24□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.24□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.24□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC24BO95487 1268 aa10.23□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.23□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.22□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 YY1P25490 414 aa10.22□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.22□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM212AQ96EL1 285 aa10.22□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.21□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SMARCE1-201ENST00000264640 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.21□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 NRAPQ86VF7 1730 aa10.21□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXO3O43524 673 aa10.2□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 BAG6P46379 1132 aa10.2□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.2□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.2□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0G2JS52 829 aa10.19□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 MYT1Q01538 1121 aa10.19□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.19□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 KIF1AQ12756 1690 aa10.18□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP155O75694 1391 aa10.18□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 NUTM2FA1L443 756 aa10.18□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 PPLO60437 1756 aa10.18□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT172Q9UG01 1749 aa10.18□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM182BQ5T319 152 aa10.17□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.17□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 HFM1A2PYH4 1435 aa10.16□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.16□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.16□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 NAIPQ13075 1403 aa10.16□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 RREB1Q92766 1687 aa10.15□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS72Q15906 364 aa10.15□□□□□ -0.78
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.15□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRB2O60241 1585 aa10.14□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.14□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.13□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.13□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.13□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.12□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 DISP2A7MBM2 1401 aa10.11□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.1□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.1□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO3Q9UK99 471 aa10.1□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 ROCK1Q13464 1354 aa10.1□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.1□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCG2P16885 1265 aa10.09□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.09□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.09□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.09□□□□□ -0.79
SMARCE1-201ENST00000264640 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.08□□□□□ -0.8
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM83GA6ND36 823 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms