RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259750.8

TTBK1-201, Transcript of tau tubulin kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTBK1, Length 6,932 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK1-201ENST00000259750 MIA2Q96PC5 1412 aa19.01■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 ESCO1Q5FWF5 840 aa19.01■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 TTC39AQ5SRH9 613 aa19.01■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.01■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 MAP7D2Q96T17 732 aa19.01■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 ATP2B2Q01814 1243 aa19■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 SYCP1Q15431 976 aa19■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 MYO6Q9UM54 1294 aa19■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.99■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 NLRP6P59044 892 aa18.99■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.99■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.98■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 RNF214Q8ND24 703 aa18.98■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 CNNM1Q9NRU3 951 aa18.97■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.97■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 ZNF428Q96B54 188 aa18.97■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 DCTN1Q14203 1278 aa18.97■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 TXLNAP40222 546 aa18.96■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 SMARCE1Q969G3 411 aa18.96■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 ADAMTS8Q9UP79 889 aa18.96■□□□□ 0.63
TTBK1-201ENST00000259750 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 ABTB2Q8N961 1025 aa18.95■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.95■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 FILIP1LQ4L180 1135 aa18.95■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 TRIM5Q9C035 493 aa18.95■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 CUX1P39880 1505 aa18.95■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.94■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.94■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 GPRASP1Q5JY77 1395 aa18.94■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 KINO60870 393 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 BACH2Q9BYV9 841 aa18.93■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.93■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.93■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 H0YHG0 523 aa18.93■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.93■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 ZHX3Q9H4I2 956 aa18.92■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.91■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 NEFHP12036 1026 aa18.91■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 STK3Q13188 491 aa18.91■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 AAMPQ13685 434 aa18.91■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.9■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 GNAI3P08754 354 aa18.9■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 TSPY26PQ9H489 355 aa18.9■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.9■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 HIP1O00291 1037 aa18.9■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.9■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 STK38Q15208 465 aa18.9■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.9■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
TTBK1-201ENST00000259750 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 ANKRD62A6NC57 917 aa18.89■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.88■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 SIL1Q9H173 461 aa18.88■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 NEK4P51957 841 aa18.88■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.88■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.88■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC69A6NI79 296 aa18.87■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 SPC24Q8NBT2 197 aa18.87■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 FIBPO43427 364 aa18.86■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 CABP4P57796 275 aa18.86■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 MTHFSP49914 203 aa18.86■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 NUP133Q8WUM0 1156 aa18.86■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.86■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 CCP110O43303 1012 aa18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 SERPINC1P01008 464 aa18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 PRKAR2BP31323 418 aa18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 DEF6Q9H4E7 631 aa18.85■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 ERLIN2O94905 339 aa18.84■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 GNAI2P04899 355 aa18.84■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 WDR97A6NE52 1622 aa18.84■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 TSPYL1Q9H0U9 437 aa18.84■□□□□ 0.61
TTBK1-201ENST00000259750 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms