RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.11■■■□□ 2.09
RFXAP-201ENST00000255476 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
RFXAP-201ENST00000255476 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.08■■■□□ 2.09
RFXAP-201ENST00000255476 NUDCQ9Y266 331 aa28.08■■■□□ 2.09
RFXAP-201ENST00000255476 USP6P35125 1406 aa28.08■■■□□ 2.09
RFXAP-201ENST00000255476 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.07■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 FKBP8Q14318 412 aa28.07■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.06■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.05■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 APAF1O14727 1248 aa28.04■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 COG3Q96JB2 828 aa28.04■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 C14orf37Q86TY3 774 aa28.04■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 NWD1Q149M9 1564 aa28.04■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.04■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 POLKQ9UBT6 870 aa28.03■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
RFXAP-201ENST00000255476 NEFLP07196 543 aa28.01■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 SSH2Q76I76 1423 aa28■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.99■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 PDE3BQ13370 1112 aa27.98■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.97■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.96■■■□□ 2.07
RFXAP-201ENST00000255476 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.94■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.94■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF521Q96K83 1311 aa27.94■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 RUNDC1Q96C34 613 aa27.93■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.93■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.93■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.92■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.91■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 STRCQ7RTU9 1775 aa27.91■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 SOX12O15370 315 aa27.91■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 NEUROD2Q15784 382 aa27.91■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.9■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 PIK3C2AO00443 1686 aa27.89■■■□□ 2.06
RFXAP-201ENST00000255476 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.87■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.87■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 ORAI2Q96SN7 254 aa27.87■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 GOLGA2Q08379 1002 aa27.86■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.86■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM94Q12767 1356 aa27.86■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.84■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 USP31Q70CQ4 1352 aa27.84■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.84■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 BCL11AQ9H165 835 aa27.84■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 NLRP6P59044 892 aa27.83■■■□□ 2.05
RFXAP-201ENST00000255476 WWC1Q8IX03 1113 aa27.83■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 IL13P35225 146 aa27.81■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 ABTB2Q8N961 1025 aa27.81■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.81■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.8■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 PSME1Q06323 249 aa27.8■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 SLFN5Q08AF3 891 aa27.8■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 NGEFQ8N5V2 710 aa27.8■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 PEAK1Q9H792 1746 aa27.8■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 FOXO3O43524 673 aa27.79■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 HMOX1P09601 288 aa27.79■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.78■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.78■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.77■■■□□ 2.04
RFXAP-201ENST00000255476 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.76■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.76■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.76■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.75■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.75■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 FCHSD2O94868 740 aa27.75■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 ATF3P18847 181 aa27.74■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 PRKAR2BP31323 418 aa27.74■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 E9PSI1 815 aa27.71■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 MST1RQ04912 1400 aa27.71■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 USP54Q70EL1 1684 aa27.7■■■□□ 2.03
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC27Q2M243 656 aa27.7■■■□□ 2.02
RFXAP-201ENST00000255476 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.69■■■□□ 2.02
RFXAP-201ENST00000255476 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
RFXAP-201ENST00000255476 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.69■■■□□ 2.02
RFXAP-201ENST00000255476 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
RFXAP-201ENST00000255476 AMPHP49418 695 aa27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms