RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.03■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 CPS1P31327 1500 aa21.03■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 ATP7BP35670 1465 aa21.02■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.02■□□□□ 0.96
GINS2-201ENST00000253462 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.01■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 E9PSI1 815 aa21.01■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 NME9Q86XW9 330 aa21.01■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.01■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 MED14O60244 1454 aa21■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 PTPRUQ92729 1446 aa21■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 PDE4AP27815 886 aa20.99■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 NGEFQ8N5V2 710 aa20.99■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 BCL11AQ9H165 835 aa20.97■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 SLIT1O75093 1534 aa20.97■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.97■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.96■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 POLKQ9UBT6 870 aa20.96■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.95
GINS2-201ENST00000253462 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 BCAR3O75815 825 aa20.95■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 TBX22Q9Y458 520 aa20.94■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 BACH2Q9BYV9 841 aa20.93■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.93■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.93■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.92■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 COG3Q96JB2 828 aa20.91■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 ACEP12821 1306 aa20.91■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 ITSN1Q15811 1721 aa20.9■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.9■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.9■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
GINS2-201ENST00000253462 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.89■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 WDR63Q8IWG1 891 aa20.89■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 CCDC27Q2M243 656 aa20.88■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.88■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 AKAP12Q02952 1782 aa20.88■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 ADGRB2O60241 1585 aa20.86■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 HMOX1P09601 288 aa20.86■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 MS4A1P11836 297 aa20.86■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 KCNA6P17658 529 aa20.86■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 RIPK4P57078 832 aa20.84■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.84■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.84■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.83■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 PRKAR2BP31323 418 aa20.83■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.83■□□□□ 0.93
GINS2-201ENST00000253462 SOX12O15370 315 aa20.83■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.82■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 FCHSD2O94868 740 aa20.81■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 PTCH1Q13635 1447 aa20.81■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.81■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.81■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.81■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.81■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.8■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 IL13P35225 146 aa20.8■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.8■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 USP6P35125 1406 aa20.79■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 DIP2AQ14689 1571 aa20.79■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.79■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.78■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 NEFMP07197 916 aa20.78■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 PANK1Q8TE04 598 aa20.77■□□□□ 0.92
GINS2-201ENST00000253462 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
GINS2-201ENST00000253462 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.76■□□□□ 0.91
GINS2-201ENST00000253462 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
GINS2-201ENST00000253462 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.76■□□□□ 0.91
GINS2-201ENST00000253462 RGS3P49796 1198 aa20.75■□□□□ 0.91
GINS2-201ENST00000253462 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
GINS2-201ENST00000253462 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
GINS2-201ENST00000253462 TNNQ9UQP3 1299 aa20.74■□□□□ 0.91
GINS2-201ENST00000253462 COG6Q9Y2V7 657 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms