RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
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HOXD9-201ENST00000249499 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
HOXD9-201ENST00000249499 HMOX1P09601 288 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXD9-201ENST00000249499 USP54Q70EL1 1684 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF428Q96B54 188 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXD9-201ENST00000249499 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
HOXD9-201ENST00000249499 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXD9-201ENST00000249499 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
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