RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227451.3

DTX4-201, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DTX4, Length 5,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-201ENST00000227451 FAM177BA6PVY3 158 aa25.09■■□□□ 1.61
DTX4-201ENST00000227451 TPM1P09493 284 aa25.08■■□□□ 1.61
DTX4-201ENST00000227451 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
DTX4-201ENST00000227451 BECN2A8MW95 431 aa25.08■■□□□ 1.61
DTX4-201ENST00000227451 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
DTX4-201ENST00000227451 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
DTX4-201ENST00000227451 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.08■■□□□ 1.61
DTX4-201ENST00000227451 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.07■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 PIP4K2BP78356 416 aa25.07■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.06■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.06■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 FYB1O15117 783 aa25.06■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 CDC45O75419 566 aa25.06■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 FSD1Q9BTV5 496 aa25.06■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.04■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 HIP1O00291 1037 aa25.03■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.03■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 GNAI2P04899 355 aa25.03■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 PSMA5P28066 241 aa25.03■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.02■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.02■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.6
DTX4-201ENST00000227451 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 SLC4A2P04920 1241 aa25.01■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.01■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 XBP1P17861 261 aa25■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.99■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.99■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 WDR63Q8IWG1 891 aa24.99■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 AKNAQ7Z591 1439 aa24.98■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.98■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 BICD2Q8TD16 824 aa24.98■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 PDE4CQ08493 712 aa24.97■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.97■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.96■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 GCC1Q96CN9 775 aa24.96■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
DTX4-201ENST00000227451 FCHSD2O94868 740 aa24.95■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 NUCB2P80303 420 aa24.95■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 BTBD11A6QL63 1104 aa24.94■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 PDE3AQ14432 1141 aa24.94■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.94■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.94■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 NAIPQ13075 1403 aa24.93■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.93■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 SLC4A3P48751 1232 aa24.92■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.92■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.92■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.91■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 MYL6BP14649 208 aa24.9■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.89■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.89■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.89■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 ABCC5O15440 1437 aa24.89■■□□□ 1.58
DTX4-201ENST00000227451 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.89■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.89■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 FANCAO15360 1455 aa24.89■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.88■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.87■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 STARD3NLO95772 234 aa24.87■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 NFE2L2Q16236 605 aa24.86■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 ZNF428Q96B54 188 aa24.86■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 FOSBP53539 338 aa24.85■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.85■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.85■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.84■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.84■■□□□ 1.57
DTX4-201ENST00000227451 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms