RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 KIF16BQ96L93 1317 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 AK9Q5TCS8 1911 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 FAM177BA6PVY3 158 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 NUCB2P80303 420 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 KIF2CQ99661 725 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 GRIN2AQ12879 1464 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.16■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 CBX1P83916 185 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC39Q9UFE4 941 aa16.15■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.14■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 CDC45O75419 566 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.14■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 DYNC1I1O14576 645 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF445P59923 1031 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.13■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 LAMC1P11047 1609 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 SYNJ2O15056 1496 aa16.11■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 TERF1P54274 439 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 PLXNC1O60486 1568 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 KIAA2012Q0VF49 1180 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 RABEP1Q15276 862 aa16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 ST18O60284 1047 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC27Q2M243 656 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 GPT2Q8TD30 523 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM63CQ9P1W3 806 aa16.09■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 HS1BP3Q53T59 392 aa16.08■□□□□ 0.17
ITGA3-201ENST00000007722 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 KIF3BO15066 747 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 LRSAM1Q6UWE0 723 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 GCC1Q96CN9 775 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 ERVK-7P63135 1459 aa16.07■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 IGSF3O75054 1194 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 CASC1Q6TDU7 716 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.06■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 AFAP1Q8N556 730 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 TSPY26PQ9H489 355 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 CABP2Q9NPB3 220 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.05■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 PDLIM2Q96JY6 352 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.04■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 MADDQ8WXG6 1647 aa16.03■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 USP25Q9UHP3 1055 aa16.02■□□□□ 0.16
ITGA3-201ENST00000007722 NEK4P51957 841 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 MYOM1P52179 1685 aa16.02■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 STK26Q9P289 416 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 IQGAP1P46940 1657 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 MCM5P33992 734 aa16.01■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 IFT140Q96RY7 1462 aa16■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 HMOX1P09601 288 aa16■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 STAC3Q96MF2 364 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.99■□□□□ 0.15
ITGA3-201ENST00000007722 KANK1Q14678 1352 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms