RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 MPLP40238 635 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP8P85298 464 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SPDYCQ5MJ68 293 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 FAM131BQ86XD5 332 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ZNF366Q8N895 744 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 C3orf20Q8ND61 904 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 THADAQ6YHU6 1953 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD62A6NC57 917 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 C2CD4BA6NLJ0 364 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 AP5Z1O43299 807 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CLDN11O75508 207 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 TPM3P06753 285 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CDH4P55283 916 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CCDC6Q16204 474 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 DNAJC24Q6P3W2 148 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 PRR23CQ6ZRP0 262 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 MON1BQ7L1V2 547 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 C14orf80Q86SX3 495 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 TMEFF1Q8IYR6 380 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 OR2T3Q8NH03 318 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 C1orf74Q96LT6 269 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 HAPLN3Q96S86 360 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 HAUS4Q9H6D7 363 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SIGLEC16A6NMB1 481 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 GJB6O95452 261 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ZNF806P0C7X5 589 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ECT2LQ008S8 904 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SULT2A1Q06520 285 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CCDC14Q49A88 953 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 FIGNQ5HY92 759 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CYP2U1Q7Z449 544 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 BNIPLQ7Z465 357 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 APCDD1Q8J025 514 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 FBRSQ9HAH7 460 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ANLNQ9NQW6 1124 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 VPS45Q9NRW7 570 aa23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 NDUFS2O75306 463 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ENDOD1O94919 500 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 NNMTP40261 264 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 PTPN9P43378 593 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ID4P47928 161 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 COPAP53621 1224 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ARMCX6Q7L4S7 300 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 STRADAQ7RTN6 431 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CACUL1Q86Y37 369 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 KDM1BQ8NB78 822 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 IQCDQ96DY2 449 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 IFNKQ9P0W0 207 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.04■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 I6L893 689 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SRGAP2O75044 1071 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 DESP17661 470 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 GPD1P21695 349 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SDHBP21912 280 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 C5orf22Q49AR2 442 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 WDR59Q6PJI9 974 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 PRSS16Q9NQE7 514 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.03■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CKAP5Q14008 2032 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 E9PAM4 449 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 PRKCIP41743 596 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 IRAK1P51617 712 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 PLA2G2CQ5R387 149 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 LYSMD4Q5XG99 296 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 PIGKQ92643 395 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 MCEEQ96PE7 176 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SYT11Q9BT88 431 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 MUC3BQ9H195 1237 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ITM2CQ9NQX7 267 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 A0A1W2PQJ5 194 aa23.01■■□□□ 1.27
SYT6-210ENST00000641643 RRM1P23921 792 aa23.01■■□□□ 1.27
SYT6-210ENST00000641643 CD6P30203 668 aa23.01■■□□□ 1.27
SYT6-210ENST00000641643 OXTRP30559 389 aa23.01■■□□□ 1.27
SYT6-210ENST00000641643 PTGER3P43115 390 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms