RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	RGS5	O15539	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GUCA1C	O95843	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	IDO1	P14902	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	S100A2	P29034	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	OXTR	P30559	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KCNQ4	P56696	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NCOA4	Q13772	614 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	EXT2	Q93063	718 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751		A0A088AWK7	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BNIP3L	O60238	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ARIH2	O95376	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MLYCD	O95822	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GDI1	P31150	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FNTA	P49354	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GLUD2	P49448	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RAB15	P59190	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	USP4	Q13107	963 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CASP8	Q14790	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	UBR7	Q8N806	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DNAJB6	O75190	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KRT36	O76013	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MYB	P10242	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	S100A5	P33763	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	IST1	P53990	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DLG1	Q12959	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751		I3L4J1	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TOR1B	O14657	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RASA4	O43374	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ANXA9	O76027	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ALPPL2	P10696	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CTNNB1	P35222	781 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ACLY	P53396	1101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	B3GAT3	O94766	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ACADM	P11310	421 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KLRC2	P26717	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms