RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TSPAN1O60635 241 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SLC25A27O95847 323 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CPA3P15088 417 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MATKP42679 507 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 AIF1P55008 147 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 KLF10Q13118 480 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PRKG1Q13976 671 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PIGGQ5H8A4 983 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SH2D4BQ5SQS7 431 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 BORAQ6PGQ7 559 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TMC7Q7Z402 723 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 NAT14Q8WUY8 206 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 P2RY11Q96G91 374 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SPATA33Q96N06 139 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 OXSMQ9NWU1 459 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SYBUQ9NX95 663 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GGA3Q9NZ52 723 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PIM2Q9P1W9 311 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PADI4Q9UM07 663 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RNF103O00237 685 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DCLK1O15075 740 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 STRNO43815 780 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MFSD11O43934 449 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TADA2AO75478 443 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MAP3K6O95382 1288 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 BAG2O95816 211 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 APOA4P06727 396 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CYP2C9P11712 490 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RAG1P15918 1043 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 GOT1P17174 413 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MGAT1P26572 445 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RGS7P49802 495 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SEMA3BQ13214 749 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PDK1Q15118 436 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PDK3Q15120 406 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HPS6Q86YV9 775 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 IRGQQ8WZA9 623 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DLG3Q92796 817 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CASS4Q9NQ75 786 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 MYLKQ15746 1914 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 A0A087WZ62 844 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TARM1B6A8C7 271 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJA2O60884 412 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 AP1G2O75843 785 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 AP2A1O95782 977 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 THRAP10827 490 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TYK2P29597 1187 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 RGS2P41220 211 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 POLE2P56282 527 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SCAPQ12770 1279 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LPCAT4Q643R3 524 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 AHI1Q8N157 1196 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF567Q8N184 647 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 DCLK2Q8N568 766 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SNX27Q96L92 541 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 SLC9A7Q96T83 725 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 LGMNQ99538 433 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00598-211ENST00000636621 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms