RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TNFRSF10BO14763 440 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CHADO15335 359 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 NPR3P17342 541 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SNX16P57768 344 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 IER5LQ5T953 404 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 EMC1Q8N766 993 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 DNASE1L2Q92874 299 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 DUSP16Q9BY84 665 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 COMMD8Q9NX08 183 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CCL26Q9Y258 94 aa22.21■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 NDUFAB1O14561 156 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ENDOD1O94919 500 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 GPD1P21695 349 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 MIPP30301 263 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 PRKCQQ04759 706 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 MORF4L2Q15014 288 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 P3H1Q32P28 736 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SLC22A12Q96S37 553 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ZWILCHQ9H900 591 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.2■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 EBAG9O00559 213 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 FAM107AO95990 144 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ABHD2P08910 425 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM110Q86TL2 294 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 NLRP14Q86W24 1093 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 HESX1Q9UBX0 185 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 USP18Q9UMW8 372 aa22.2■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TLDC2A0PJX2 215 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 E5RJQ4 531 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CD72P21854 359 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CCT5P48643 541 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 VPS41P49754 854 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ARSEP51690 589 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 STARD6P59095 220 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GKN1Q9NS71 199 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.19■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PTPRDP23468 1912 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PI15O43692 258 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PFKLP17858 780 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 AOC1P19801 751 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ATP5DP30049 168 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SRLQ86TD4 932 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 VSIG1Q86XK7 387 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 FAM107BQ9H098 131 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CYLDQ9NQC7 956 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 IL37Q9NZH6 218 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GGA2Q9UJY4 613 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.18■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 GMNCA6NCL1 334 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CST8O60676 142 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 ACSL3O95573 720 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SCNN1AP37088 669 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 KYNUQ16719 465 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 PCGF5Q86SE9 256 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TTC30AQ86WT1 665 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 KCTD6Q8NC69 237 aa22.17■■□□□ 1.14
SGMS1-210ENST00000619438 TTC8Q8TAM2 541 aa22.17■■□□□ 1.14
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