RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392		Q6ZNB5	142 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	P3H4	Q92791	437 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.15	□□□□□ -0.3
CELF4-222	ENST00000601392	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392		E9PAM4	449 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CREB3	O43889	395 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	KLKB1	P03952	638 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CKM	P06732	381 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TUBB	P07437	444 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RHOQ	P17081	205 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	GJA1	P17302	382 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	AOC1	P19801	751 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	AMPD1	P23109	780 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	EPHB2	P29323	1055 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SERPINB6	P35237	376 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NUBP1	P53384	320 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NHLH1	Q02575	133 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF33A	Q06730	810 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TEAD2	Q15562	447 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	KAZN	Q674X7	775 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RUBCN	Q92622	972 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SHD	Q96IW2	340 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SIK2	Q9H0K1	926 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	OBP2A	Q9NY56	170 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NEU3	Q9UQ49	428 aa		13.14	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	KRBA1	A5PL33	1030 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	FAM187A	A6NFU0	413 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	GFRA2	O00451	464 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	LIAS	O43766	372 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ITGAV	P06756	1048 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	HMBS	P08397	361 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TACR2	P21452	398 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CHKA	P35790	457 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ZXDB	P98169	803 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392		F5H5T6	163 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	LEFTY2	O00292	366 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MX2	P20592	715 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MAPKAPK2	P49137	400 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31

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