RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 STILQ15468 1287 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TAC4Q86UU9 113 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 AADATQ8N5Z0 425 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T34Q8NGX1 318 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 LMO3Q8TAP4 145 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CRELD1Q96HD1 420 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 OMDQ99983 421 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FZD4Q9ULV1 537 aa26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FASNP49327 2511 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PR77 199 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC72A6NJI9 287 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD8P48556 350 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN6P56747 220 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 NNTQ13423 1086 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 RRAGAQ7L523 313 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SCUBE3Q8IX30 993 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 APCDD1Q8J025 514 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA20Q8TB22 786 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM149B1Q96BN6 582 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM129BQ96TA1 746 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ITIH6Q6UXX5 1313 aa26.54■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WV48 116 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PMM2O15305 246 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ADPRHP54922 357 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SYPL2Q5VXT5 272 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF19Q8IW93 802 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 LGI2Q8N0V4 545 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 STK40Q8N2I9 435 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SAP25Q8TEE9 199 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 KNL1Q8NG31 2342 aa26.53■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PLK4O00444 970 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ENC1O14682 589 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGAVP06756 1048 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CD38P28907 300 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 GPD2P43304 727 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL34P49207 117 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 NUMBP49757 651 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ECT2LQ008S8 904 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC3Q13217 504 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 RAP1GAP2Q684P5 730 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS12Q86WS5 348 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRN2Q92932 1015 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SKA1Q96BD8 255 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ST7Q9NRC1 585 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP83Q9Y592 693 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa26.52■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa26.51■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 GOT1P17174 413 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCB4P21439 1286 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 STK19P49842 368 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR5P51681 352 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCE1Q969G3 411 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF3Q9NR23 364 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ACACAQ13085 2346 aa26.51■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SMC2O95347 1197 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 MOCS3O95396 460 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 VAV1P15498 845 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CD44P16070 742 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TACR2P21452 398 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 C5AR1P21730 350 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2CBP62714 309 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2CAP67775 309 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC40Q4G0X9 1142 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.837e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-211ENST00000590874 CHSY1Q86X52 802 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OR14C36Q8NHC7 312 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SERAC1Q96JX3 654 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP63Q96MT8 703 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 KREMEN1Q96MU8 473 aa26.5■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 E9PAM4 449 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMA7O14818 248 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 SART1O43290 800 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 RFPL3O75679 317 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ADH1BP00325 375 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ACADVLP49748 655 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 METAP1P53582 386 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 NXPH1P58417 271 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 GCNT1Q02742 428 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 ISM2Q6H9L7 571 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND1BQ6P3S1 775 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 EID2Q8N6I1 236 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 DCBLD2Q96PD2 775 aa26.49■■□□□ 1.83
CAPNS1-211ENST00000590874 TJP2Q9UDY2 1190 aa26.49■■□□□ 1.83
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