RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 E9PAM4 449 aa27.14■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATF6P18850 670 aa27.14■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MSH2P43246 934 aa27.14■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CEP295NLQ96MC4 621 aa27.14■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRHDEQ9UKU6 1024 aa27.14■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC38A8A6NNN8 435 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NDUFAB1O14561 156 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRT15P19012 456 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR1D2P34982 312 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TUBP50607 506 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIK3R6Q5UE93 754 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIAA1841Q6NSI8 718 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRRC8BQ6P9F7 803 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NECAB2Q7Z6G3 386 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GIPC2Q8TF65 315 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DPF3Q92784 378 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCNK9Q9NPC2 374 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TTLL3Q9Y4R7 772 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NUP205Q92621 2012 aa27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 APOEP02649 317 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPL17P18621 184 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C14orf80Q86SX3 495 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DCAKDQ8WVC6 231 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TSGA13Q96PP4 275 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCT8L2Q96SF2 557 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TTLL2Q9BWV7 592 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLAC1Q9HBJ0 212 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MARCH2Q9P0N8 246 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TBX18O95935 607 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM107AO95990 144 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TUFMP49411 452 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZBTB17Q13105 803 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TEX44Q53QW1 395 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C10orf120Q5SQS8 335 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FOXR1Q6PIV2 292 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MPP5Q8N3R9 675 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF558Q96NG5 402 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GBA3Q9H227 469 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRABDQ9H4I3 376 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC134Q9H6E4 229 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa27.12■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIAS1O75925 651 aa27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TIMP1P01033 207 aa27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SOD2P04179 222 aa27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UNC5AQ6ZN44 842 aa27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GORASP1Q9BQQ3 440 aa27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RSPH14Q9UHP6 348 aa27.11■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WASH4PA8MWX3 477 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DFFAO00273 331 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C1QAP02745 245 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCNCP24863 283 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ITGB8P26012 769 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DEFB103AP81534 67 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MPP2Q14168 576 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC39A11Q8N1S5 342 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATPAF2Q8N5M1 289 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SHROOM3Q8TF72 1996 aa27.1■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C2CD2LO14523 706 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRKCHP24723 683 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CD68P34810 354 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MIB1Q86YT6 1006 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF683Q8IZ20 524 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC44A1Q8WWI5 657 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TEKT5Q96M29 485 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AGAP3Q96P47 875 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLSTN3Q9BQT9 956 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FNIP2Q9P278 1114 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SDR42E2A6NKP2 422 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IGLV3-27P01718 113 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CSF2RAP15509 400 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MS4A13Q5J8X5 152 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AFMIDQ63HM1 303 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANKRD42Q8N9B4 389 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GSDMBQ8TAX9 411 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM169Q96HH4 297 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BTN2A3PQ96KV6 586 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMC6Q96SB8 1091 aa27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms