RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	NOD2	Q9HC29	1040 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT84	Q9NSB2	600 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MRGBP	Q9NV56	204 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MTRR	Q9UBK8	725 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MED16	Q9Y2X0	877 aa		3.07	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM234B	A2RU67	622 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPY2	A6NKD2	308 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AQP12B	A6NM10	295 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957		E5RJQ4	531 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957		H0Y626	953 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MLYCD	O95822	493 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ALPL	P05186	524 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	QDPR	P09417	244 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPY3	P0CV98	308 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPY8	P0CW00	308 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NPPB	P16860	134 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HDC	P19113	662 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTN2	P35609	894 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT2	P35908	639 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK7	P50613	346 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CCR9	P51686	369 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CLCN2	P51788	898 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPY1	Q01534	308 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SATB1	Q01826	763 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MAMLD1	Q13495	774 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RASA2	Q15283	850 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	C5orf22	Q49AR2	442 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	RTL10	Q7L3V2	364 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MICU3	Q86XE3	530 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ADSSL1	Q8N142	457 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10A4	Q9H209	315 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	MAFF	Q9ULX9	164 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		3.06	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FLT1	P17948	1338 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FYB1	O15117	783 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ASNA1	O43681	348 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D4	O60343	1298 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAR3	O75815	825 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTL6B	O94805	426 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PGM3	O95394	542 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF6B	O95407	300 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	FGB	P02675	491 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CSH1	P0DML2	217 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	CSH2	P0DML3	217 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFB7	P17568	137 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	EGR1	P18146	543 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KLRC1	P26715	233 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF5B	P33176	963 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCD1	P33897	745 aa		3.05	□□□□□ -1.92
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 249.9 ms