RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555227.1

LINC01578-205, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1578, human

TSL 5

Gene LINC01578, Length 1,078 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01578-205	ENST00000555227	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	NCK2	O43639	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	CNTN5	O94779	1100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	CYP1A2	P05177	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	MORC3	Q14149	939 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	CSHL1	Q14406	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61	4e-7	■■■□□ 16.7
LINC01578-205	ENST00000555227	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01578-205	ENST00000555227	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PPP6R2	O75170	966 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	NDST3	O95803	873 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	WNT1	P04628	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	TSHR	P16473	764 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	GALNT3	Q14435	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227		Q5PR19	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227		Q6ZTK2	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	CDT1	Q9H211	546 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	NPC1	O15118	1278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	EGR1	P18146	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ABCB4	P21439	1286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	SLC37A1	P57057	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	DSCR9	P59020	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PMPCA	Q10713	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PODXL	O00592	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	LCK	P06239	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PCYT1A	P49585	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	BTK	Q06187	659 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	GPR18	Q14330	331 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	NR4A3	Q92570	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINC01578-205	ENST00000555227	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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