RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 CBFA2T2O43439 604 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 KLKB1P03952 638 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 EPHX1P07099 455 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ACADMP11310 421 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 LGMNQ99538 433 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 MARK1Q9P0L2 795 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ATP8B3O60423 1300 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 F8VZ95 297 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TLR5O60602 858 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 IGLV3-19P01714 112 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TPM3P06753 285 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 VDRP11473 427 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 C6P13671 934 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 OXTRP30559 389 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 HNF1BP35680 557 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 GRIA4P48058 902 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 JAM2P57087 298 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ENPP2Q13822 863 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SGO2Q562F6 1265 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TFAP2BQ92481 460 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TSC1Q92574 1164 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 MED10Q9BTT4 135 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 NMUR1Q9HB89 426 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 FBXO10Q9UK96 956 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 PLXNA2O75051 1894 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 O00370 1275 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CYP26A1O43174 497 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TSPAN3O60637 253 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 AP1G2O75843 785 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CALCAP01258 141 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 MPOP05164 745 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 IGHV4-34P06331 123 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 HMBSP08397 361 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 MYF5P13349 255 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CD19P15391 556 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 GLDCP23378 1020 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ADORA2BP29275 332 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CLCN1P35523 988 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 USP8P40818 1118 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TEAD4Q15561 434 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 FIGNQ5HY92 759 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 FYB2Q5VWT5 728 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SMOQ99835 787 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 DUSP16Q9BY84 665 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CIPCQ9C0C6 399 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ACP6Q9NPH0 428 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 KRT82Q9NSB4 513 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 EHD2Q9NZN4 543 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 COL6A6A6NMZ7 2263 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SEMA4FO95754 770 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ITGAVP06756 1048 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 FAM200BP0CF97 657 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 PTK2Q05397 1052 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 STILQ15468 1287 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CNGA2Q16280 664 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 Q6ZNB5 142 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SAP25Q8TEE9 199 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SPAG5Q96R06 1193 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 LHX5Q9H2C1 402 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 IL37Q9NZH6 218 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 SERGEFQ9UGK8 458 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 MYH10P35580 1976 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 CD27P26842 260 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-231ENST00000552222 GNA15P30679 374 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms