RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CCNYQ8ND76 341 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RSAD1Q9HA92 442 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF221Q9UK13 617 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CES1P23141 567 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KLRC1P26715 233 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CEBPGP53567 150 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF45Q02386 682 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RNF220Q5VTB9 566 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL35Q6PF15 583 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CYB5R4Q7L1T6 521 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KRT78Q8N1N4 520 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AGAP11Q8TF27 550 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PANX2Q96RD6 677 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PIGUQ9H490 435 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF879B4DU55 563 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD9O00233 223 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LAMTOR5O43504 91 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RTN2O75298 545 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PGK2P07205 417 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CAPZA2P47755 286 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LIN52Q52LA3 116 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KCND1Q9NSA2 647 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR6Q9Y217 621 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FOXP2O15409 715 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEC1O60732 1142 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ASGR1P07306 291 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PMLP29590 882 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SHMT1P34896 483 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf54Q08AI8 447 aa6.44□□□□□ -1.38
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PTPRB-210ENST00000551525 PRKG2Q13237 762 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF677Q86XU0 584 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PLD3Q8IV08 490 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LEMD2Q8NC56 503 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C12orf42Q96LP6 360 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 XKR8Q9H6D3 395 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AK5Q9Y6K8 562 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GPC4O75487 556 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RTP1P59025 263 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CENPCQ03188 943 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DPYDQ12882 1025 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ITGADQ13349 1161 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KRT12Q99456 494 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RAD18Q9NS91 495 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ILVBLA1L0T0 632 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM92AA1XBS5 289 aa6.43□□□□□ -1.38
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