RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GVM2	712 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	LRRC53	A6NM62	1247 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MAP3K13	O43283	966 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ZNF217	O75362	1048 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CAVIN2	O95810	425 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	C7	P10643	843 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PDGFRA	P16234	1089 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	E2F5	Q15329	346 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CCDC14	Q49A88	953 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	FAM131B	Q86XD5	332 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	OR2T3	Q8NH03	318 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ALG14	Q96F25	216 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	VPS45	Q9NRW7	570 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MYO6	Q9UM54	1294 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	THADA	Q6YHU6	1953 aa		21.53	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PATE3	B3GLJ2	98 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CNTN5	O94779	1100 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ENDOD1	O94919	500 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	F9	P00740	461 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PTMS	P20962	102 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	PBX1	P40424	430 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP8	P85298	464 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ATP11A	P98196	1134 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	FANCC	Q00597	558 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	MTA1	Q13330	715 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ALF	Q53S48	1182 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		21.52	■■□□□ 1.04
CS-222	ENST00000550996	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	SERPINC1	P01008	464 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	ASL	P04424	464 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	ITPKA	P23677	461 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	TPMT	P51580	245 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	PIGK	Q92643	395 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	DRGX	A6NNA5	263 aa		21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	TTC34	A8MYJ7	566 aa		21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	CDO1	Q16878	200 aa		21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	C3orf20	Q8ND61	904 aa		21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	AP5Z1	O43299	807 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	IGLV3-19	P01714	112 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	CALB1	P05937	261 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	KRT3	P12035	628 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	CD6	P30203	668 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	PTPN9	P43378	593 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	PLK1	P53350	603 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	ECT2L	Q008S8	904 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	ASIC2	Q16515	512 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	WDR59	Q6PJI9	974 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	NETO1	Q8TDF5	533 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	C1orf74	Q96LT6	269 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		21.49	■■□□□ 1.03
CS-222	ENST00000550996	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		21.49	■■□□□ 1.03

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