RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549558.6

ANKS1B-216, Transcript of ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKS1B, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKS1B-216ENST00000549558 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 BRD7Q9NPI1 651 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 MED4Q9NPJ6 270 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 KCND3Q9UK17 655 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 TLK1Q9UKI8 766 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.51□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 XKRY2A2RUG3 117 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 LRRD1A4D1F6 860 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 RGS13O14921 159 aa6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 KCNK5O95279 499 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 YEATS4O95619 227 aa6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 PHC2Q8IXK0 858 aa6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 VAV3Q9UKW4 847 aa6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 ISM1B1AKI9 464 aa6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 C2CD2LO14523 706 aa6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 KCNA5P22460 613 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 PTAFRP25105 342 aa6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 PTK6Q13882 451 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 VEPH1Q14D04 833 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 RCN1Q15293 331 aa6.5□□□□□ -1.37
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ANKS1B-216ENST00000549558 TCTE1Q5JU00 501 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 LCORLQ8N3X6 602 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 TTLL6Q8N841 843 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 ZIC5Q96T25 663 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 TEX12Q9BXU0 123 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 WDR26Q9H7D7 661 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 CD209Q9NNX6 404 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ANKS1B-216ENST00000549558 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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