RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 HIC2Q96JB3 615 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CNPY3Q9BT09 278 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 C1orf21Q9H246 121 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 LHX5Q9H2C1 402 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 VCX3BQ9H321 246 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 COG4Q9H9E3 785 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 LACTBL1A8MY62 500 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 MED7O43513 233 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 STRNO43815 780 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ARSAP15289 507 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TSHRP16473 764 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 L1CAMP32004 1257 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ALDH1A3P47895 512 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 FCGRTP55899 365 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PPP2R5DQ14738 602 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PDK1Q15118 436 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 AMHR2Q16671 573 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CPB2Q96IY4 423 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ZNF195O14628 629 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 GABRB2P47870 512 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 NUDT2P50583 147 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CLCN3P51790 818 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CHN2P52757 468 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 IGBP1P78318 339 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ENPEPQ07075 957 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 MORN1Q5T089 497 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TMEM198Q66K66 360 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PACS1Q6VY07 963 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 AGAP3Q96P47 875 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 LCTP09848 1927 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 EVPLQ92817 2033 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 VILLO15195 856 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CHRNGP07510 517 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 RALBP11234 206 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 COX4I1P13073 169 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TYK2P29597 1187 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ACAP1Q15027 740 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 STILQ15468 1287 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 NADK2Q4G0N4 442 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 HAPLN3Q96S86 360 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 LZTS1Q9Y250 596 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 MAFGO15525 162 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TFAP2AP05549 437 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PCSK6P29122 969 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 EPHA3P29320 983 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 NCSTNQ92542 709 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CREB3O43889 395 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CILPO75339 1184 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 GABBR2O75899 941 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 KLHL2O95198 593 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 LTFP02788 710 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 PFKMP08237 780 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 EDNRBP24530 442 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 BEX3Q00994 111 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 AAGABQ6PD74 315 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 CDRT15Q96T59 188 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 AGAP2Q99490 1192 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 GALNT8Q9NY28 637 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 BIRC5O15392 142 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ITGA2BP08514 1039 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 ZNF286BP0CG31 522 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 FDFT1P37268 417 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-214ENST00000543184 HDAC4P56524 1084 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms