RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541102.1

LTBR-209, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LTBR, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-209ENST00000541102 FLT3P36888 993 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PTGER3P43115 390 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 RAB6CQ53S08 254 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 AHI1Q8N157 1196 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 EMC1Q8N766 993 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ZNF366Q8N895 744 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 ISCUQ9H1K1 167 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 CD93Q9NPY3 652 aa14.71□□□□□ -0.05
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LTBR-209ENST00000541102 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBR-209ENST00000541102 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 ZNF217O75362 1048 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 DAB1O75553 588 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 SLC2A3P11169 496 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 GZMAP12544 262 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 ABCB4P21439 1286 aa14.7□□□□□ -0.06
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LTBR-209ENST00000541102 LMAN2Q12907 356 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 CDH18Q13634 790 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 ENPP2Q13822 863 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 CACUL1Q86Y37 369 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 TMEM139Q8IV31 216 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 FIBINQ8TAL6 211 aa14.7□□□□□ -0.06
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LTBR-209ENST00000541102 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 SPTBN2O15020 2390 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.69□□□□□ -0.06
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LTBR-209ENST00000541102 F5H5T6 163 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 H0Y626 953 aa14.69□□□□□ -0.06
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LTBR-209ENST00000541102 SLC30A4O14863 429 aa14.69□□□□□ -0.06
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LTBR-209ENST00000541102 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 PTPRNQ16849 979 aa14.69□□□□□ -0.06
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LTBR-209ENST00000541102 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 LYSMD4Q5XG99 296 aa14.69□□□□□ -0.06
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LTBR-209ENST00000541102 SULT1E1P49888 294 aa14.68□□□□□ -0.06
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LTBR-209ENST00000541102 SLC18A3Q16572 532 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 STPG1Q5TH74 334 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 IL31Q6EBC2 164 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 C3orf20Q8ND61 904 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBR-209ENST00000541102 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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