RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 F8VP50 259 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FYNP06241 537 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SULT2A1Q06520 285 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SMARCB1Q12824 385 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TUSC3Q13454 348 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KCNMB4Q86W47 210 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GPR25O00155 361 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MEIS2O14770 477 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PTENP60484 403 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GCNT1Q02742 428 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MPP3Q13368 585 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CRY1Q16526 586 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GANQ9H2C0 597 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RNF103O00237 685 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PGAM1P18669 254 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MGAT1P26572 445 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 UGCGQ16739 394 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CHST9Q7L1S5 443 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TC2NQ8N9U0 490 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SCLYQ96I15 445 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PQH9 124 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TLR5O60602 858 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PCCBP05166 539 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6V1C1P21283 382 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PPP2R1BP30154 601 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CCR4P51679 360 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 NTRK3Q16288 839 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DEC1Q9P2X7 70 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 IFNA14P01570 189 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KRT6AP02538 564 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KRT6BP04259 564 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 DGKAP23743 735 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KRT6CP48668 564 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 GRTP1Q5TC63 336 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TTI2Q6NXR4 508 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087X0T9 212 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 ACSL4O60488 711 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FAM228BP0C875 321 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MPPE1Q53F39 396 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 AGMOQ6ZNB7 445 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 STK40Q8N2I9 435 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 RIN3Q8TB24 985 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 C2CD2Q9Y426 696 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-204ENST00000538708 PER2O15055 1255 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OR4Q2P0C623 313 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ELFN1P0C7U0 828 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CNTFP26441 200 aa9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms