RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529655.5

ATG13-215, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-215ENST00000529655 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 DCLK2Q8N568 766 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 KCNK16Q96T55 309 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 UBP1Q9NZI7 540 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ATP9BO43861 1147 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ZMPSTE24O75844 475 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 TOMM70O94826 608 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 BAG2O95816 211 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 FYNP06241 537 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 NPR3P17342 541 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 TPH1P17752 444 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ERCC2P18074 760 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 NOS2P35228 1153 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 USP4Q13107 963 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 DPYSQ14117 519 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 TMEM154Q6P9G4 183 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CYS1Q717R9 158 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 NPWQ8N729 165 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ATP2A3Q93084 1043 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ZNF560Q96MR9 790 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 TINF2Q9BSI4 451 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 SNX15Q9NRS6 342 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 KRT34O76011 436 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 SERPINE1P05121 402 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 POLBP06746 335 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 PTPN3P26045 913 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CPOXP36551 454 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 SCNN1AP37088 669 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 IDH3AP50213 366 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 FAM136AQ96C01 138 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 MFSD3Q96ES6 412 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 TNIP3Q96KP6 325 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 COPG2Q9UBF2 871 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 IPPQ9Y573 584 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 BRCA2P51587 3418 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 DCLK1O15075 740 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 SIN3BO75182 1162 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CIB2O75838 187 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 RALBP11234 206 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CD1EP15812 388 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CACNA2D1P54289 1103 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 KLC1Q07866 573 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 PPP2R5DQ14738 602 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 SV2CQ496J9 727 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ACMSDQ8TDX5 336 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 WNT8BQ93098 351 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CYP4F11Q9HBI6 524 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 A0A088AWK7 358 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 PDE5AO76074 875 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 ANPEPP15144 967 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 EPHX2P34913 555 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 GCKP35557 465 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 GP5P40197 560 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 EPHB1P54762 984 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 CCL15Q16663 113 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 EDEM1Q92611 657 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 NT5C3BQ969T7 300 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 NRCAMQ92823 1304 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG13-215ENST00000529655 USP17L7P0C7H9 530 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms