RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526255.1

RCOR3-208, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 1 (best)

Gene RCOR3, Length 909 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-208	ENST00000526255	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ALK	Q9UM73	1620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	KLK10	O43240	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	F9	P00740	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ALAD	P13716	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PTGS2	P35354	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RCAN1	P53805	252 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TAS2R50	P59544	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	GPC5	P78333	572 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PSG6	Q00889	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PRKG2	Q13237	762 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	BFSP2	Q13515	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	AFF2	P51816	1311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255		K7ENM7	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CA12	O43570	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TULP3	O75386	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ITGAM	P11215	1152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ABCD3	P28288	659 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	GRK5	P34947	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PCP4	P48539	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	CFHR3	Q02985	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	HAS1	Q92839	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCOR3-208	ENST00000526255	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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