RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 Q5PR19 223 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TTC30AQ86WT1 665 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 FAR2Q96K12 515 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 HECW1Q76N89 1606 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PPC4 97 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CCER2I3L3R5 266 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KPNA5O15131 536 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GABRB3P28472 473 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 DSCR9P59020 149 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CSHL1Q14406 222 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 WDR93Q6P2C0 686 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RNF152Q8N8N0 203 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 NPIPB3Q92617 1050 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TTC17Q96AE7 1141 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 DCLK3Q9C098 648 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.42□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GCC2Q8IWJ2 1684 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RASSF2P50749 326 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZTK2 550 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GPSM1Q86YR5 675 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TTC8Q8TAM2 541 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa5.41□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 MYOM3Q5VTT5 1437 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 OR6C75A6NL08 312 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KAT7O95251 611 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 NDST3O95803 873 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CYP1A2P05177 515 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CASP5P51878 434 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RTL10Q7L3V2 364 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CUZD1Q86UP6 607 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KAT2AQ92830 837 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TM6SF1Q9BZW5 370 aa5.4□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 NAIPQ13075 1403 aa5.4□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 NCOA2Q15596 1464 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 J3KTA2 159 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 APOL1O14791 398 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 DHHO43323 396 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 IGKV3-20P01619 116 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 ITGA5P08648 1049 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 ATF3P18847 181 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 STT3AP46977 705 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 PMPCAQ10713 525 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 GALNT3Q14435 633 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 ALG10Q5BKT4 473 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 C14orf80Q86SX3 495 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 NR4A3Q92570 626 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 RGL1Q9NZL6 768 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 TNFSF13BQ9Y275 285 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 PTPRKQ15262 1439 aa5.39□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 INAFM1C9JVW0 142 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 SPRY3O43610 288 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 PCYT1AP49585 367 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 GPR18Q14330 331 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 SHBQ15464 509 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 C10orf76Q5T2E6 689 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.38□□□□□ -1.55
SGCE-211ENST00000522045 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms