RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513974.5

RAI14-222, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 4

Gene RAI14, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-222	ENST00000513974	SCML4	Q8N228	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	TRIM38	O00635	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	GCLM	P48507	274 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	LY6D	Q14210	128 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	STAT4	Q14765	748 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	SLC25A45	Q8N413	288 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	EDEM1	Q92611	657 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974		E7ENQ6	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	KLK10	O43240	276 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	SLC7A4	O43246	635 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	KLRC4	O43908	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	OPA1	O60313	960 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	ACSL4	O60488	711 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	YEATS4	O95619	227 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MPO	P05164	745 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	GP1BA	P07359	652 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	CKMT1A	P12532	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	SLC6A4	P31645	630 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	GTF2H1	P32780	548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	AFM	P43652	599 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	PSMD8	P48556	350 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	GABRE	P78334	506 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	DAB2	P98082	770 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	NFIL3	Q16649	462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	OR4C6	Q8NH72	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	PTPRN2	Q92932	1015 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAI14-222	ENST00000513974	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	TULP2	O00295	520 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	USP12	O75317	370 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	MOCS3	O95396	460 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	KRT13	P13646	458 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	CSRP3	P50461	194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	PPP2CB	P62714	309 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	PPP2CA	P67775	309 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	ECT2L	Q008S8	904 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	KRT39	Q6A163	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	STK40	Q8N2I9	435 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	STIM2	Q9P246	746 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974		K7ENP7	123 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	SLC28A2	O43868	658 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	SDC3	O75056	442 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAI14-222	ENST00000513974	IL1B	P01584	269 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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