RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, human

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2B-208	ENST00000511807	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807		E7ENQ6	273 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	DAB1	O75553	588 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	GRAP2	O75791	330 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	CFI	P05156	583 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	HOXB2	P14652	356 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	GABRG2	P18507	467 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	GPD1	P21695	349 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	SDC4	P31431	198 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	NOS2	P35228	1153 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	MATK	P42679	507 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	LMAN2	Q12907	356 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	FOXC1	Q12948	553 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ACAP1	Q15027	740 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	SYT12	Q8IV01	421 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	DEFB119	Q8N690	84 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	RNF139	Q8WU17	664 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	BHMT	Q93088	406 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	MCEE	Q96PE7	176 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		11.75	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ACACB	O00763	2458 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807		A0A1W2PQH9	124 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	MDM4	O15151	490 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	BUB1	O43683	1085 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	KIF5C	O60282	957 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	RNF8	O76064	485 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	NCAM1	P13591	858 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	RARG	P13631	454 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	TYR	P14679	529 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ITPKA	P23677	461 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	NTSR1	P30989	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	TAF5	Q15542	800 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	DEFB106A	Q8N104	65 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ACOX2	Q99424	681 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	CNPY3	Q9BT09	278 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	NMUR1	Q9HB89	426 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807		A0A0U1RQJ8	604 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	PRRT4	C9JH25	899 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	CACNG3	O60359	315 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	GREM1	O60565	184 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	GJB6	O95452	261 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	F9	P00740	461 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	CEACAM1	P13688	526 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	ENG	P17813	658 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	SPINK2	P20155	84 aa		11.73	□□□□□ -0.53
UBE2B-208	ENST00000511807	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53

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