RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CENPUQ71F23 418 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CCHCR1Q8TD31 782 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 HDAC11Q96DB2 347 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CFAP36Q96G28 342 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA17Q96L03 361 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 C11orf49Q9H6J7 331 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SYBUQ9NX95 663 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 OR6C75A6NL08 312 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 J3KR12 359 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TRIM66O15016 1216 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAPPC3O43617 180 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 LILRB3O75022 631 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA31D3P0C874 917 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 NFKB1P19838 968 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TPSB2P20231 275 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 DRD4P21917 467 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MGAT1P26572 445 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PGGT1BP53609 377 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ARL4CP56559 192 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TPSAB1Q15661 275 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC1A5Q15758 541 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MIB1Q86YT6 1006 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 C4orf33Q8N1A6 199 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PGBD5Q8N414 524 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 DENND1AQ8TEH3 1009 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 FBXO32Q969P5 355 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF778Q96MU6 729 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PAFAH2Q99487 392 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SELENOSQ9BQE4 189 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 APOL2Q9BQE5 337 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TLR6Q9Y2C9 796 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PSAT1Q9Y617 370 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 USP34Q70CQ2 3546 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM120BA0PK00 339 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 HACD1B0YJ81 288 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 H3BNC9 293 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 KIAA0355O15063 1070 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TYROBPO43914 113 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CACNG3O60359 315 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GREM1O60565 184 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 HLA-DQB2P05538 268 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MMP2P08253 660 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PAX3P23760 479 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 DNAJB2P25686 324 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 AIF1P55008 147 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 FBXL22Q6P050 247 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 LEKR1Q6ZMV7 388 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ATG14Q6ZNE5 492 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PCGF5Q86SE9 256 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 TDRPQ86YL5 185 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 CCNYQ8ND76 341 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 RIN3Q8TB24 985 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 MGARPQ8TDB4 240 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 AGAP3Q96P47 875 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 HAPLN3Q96S86 360 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-212ENST00000497037 PHACTR1Q9C0D0 580 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms