RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THSD1Q9NS62 852 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DACT1Q9NYF0 836 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UTS2RQ9UKP6 389 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHA12Q9UN75 941 aa5.09□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EFCAB8A8MWE9 144 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPN2O95208 641 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP21A2P08686 494 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSG1P11464 419 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADPRHP54922 357 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00205P59089 165 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP2B1P63010 937 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXO1Q12778 655 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TANGO2Q6ICL3 276 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KAT2AQ92830 837 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EME1Q96AY2 570 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POT1Q9NUX5 634 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRFN1Q9P244 771 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa5.08□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGAP5A6NIR3 686 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TULP3O75386 442 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BLMHQ13867 455 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLGAP5Q15398 846 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNTL6Q49A17 601 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ISM2Q6H9L7 571 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL17Q6TDP4 642 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDIASQ8IXT1 998 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGEH1Q9H213 219 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COG5Q9UP83 839 aa5.07□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNJ18B7U540 433 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCIDASD6RGH6 385 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFB8O95169 186 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TOMM40O96008 361 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCT4P50991 539 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RCAN1P53805 252 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT72Q14CN4 511 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC38Q502W7 563 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MANEAQ5SRI9 462 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IP6K1Q92551 441 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RCE1Q9Y256 329 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DTX4Q9Y2E6 619 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTC3P53804 2025 aa5.06□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPPA5A6NC42 116 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXorf65A6NEN9 183 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A6NNC1 897 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHODO00212 210 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM14Q14142 442 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCTN1Q14203 1278 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C10orf76Q5T2E6 689 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERAP2Q6P179 960 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC174Q6PII3 467 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIM3Q86V86 326 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DECR2Q9NUI1 292 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.05□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.04□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa5.04□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa5.04□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.04□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEURL1O76050 574 aa5.04□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFATC1O95644 943 aa5.04□□□□□ -1.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBSLP0DN79 551 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms