RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495292.1

FAM107B-227, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-227	ENST00000495292	PRKCH	P24723	683 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	HLA-F	P30511	346 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	GNA15	P30679	374 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	GPD2	P43304	727 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	MAPK8	P45983	427 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	RGS7	P49802	495 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TPMT	P51580	245 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	COPA	P53621	1224 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TBX4	P57082	545 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SNX16	P57768	344 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SEMA3B	Q13214	749 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	RRAGA	Q7L523	313 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	MFN1	Q8IWA4	741 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	KDM1B	Q8NB78	822 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	OR2T3	Q8NH03	318 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	P2RY11	Q96G91	374 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	NUP58	Q9BVL2	599 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM245	Q9H330	911 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ST7	Q9NRC1	585 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM51	Q9NW97	253 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	GGA2	Q9UJY4	613 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SCML1	Q9UN30	329 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	PTPRB	P23467	1997 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	CACNA1B	Q00975	2339 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		6.74	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	NUMA1	Q14980	2115 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292		H0Y626	953 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	THAP12	O43422	761 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TBL1X	O60907	577 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TRIM16	O95361	564 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	MOCS3	O95396	460 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	DNTT	P04053	509 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ASL	P04424	464 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	GLI1	P08151	1106 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC2A3	P11169	496 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	STX17	P56962	302 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ST8SIA6	P61647	398 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC12A1	Q13621	1099 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	CDH18	Q13634	790 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ST3GAL2	Q16842	350 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM215	Q68D42	235 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	MBLAC2	Q68D91	279 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	GBP6	Q6ZN66	633 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	CHST9	Q7L1S5	443 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	PIP4P1	Q86T03	277 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TMEM110	Q86TL2	294 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SVOP	Q8N4V2	548 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	MLKL	Q8NB16	471 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	KAT5	Q92993	513 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	NOX5	Q96PH1	765 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	MIS12	Q9H081	205 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	LHX5	Q9H2C1	402 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	THAP9	Q9H5L6	903 aa		6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
FAM107B-227	ENST00000495292	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		6.73	□□□□□ -1.33

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