RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 DDI1Q8WTU0 396 aa22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 BHMTQ93088 406 aa22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 WASH4PA8MWX3 477 aa22.65■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 C5orf22Q49AR2 442 aa22.65■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.65■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 AMACRQ9UHK6 382 aa22.65■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.65■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 CLDN11O75508 207 aa22.65■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.65■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 LMNB2Q03252 620 aa22.64■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 PDK1Q15118 436 aa22.64■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 TTC27Q6P3X3 843 aa22.64■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.64■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 UBXN4Q92575 508 aa22.64■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.64■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 H0Y626 953 aa22.63■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 MAPKAPK2P49137 400 aa22.63■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 DR1Q01658 176 aa22.63■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.63■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.63■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC3BQ96PB8 259 aa22.63■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.63■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.63■■□□□ 1.21
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PSPC1-204ENST00000492741 CHST9Q7L1S5 443 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 HLA-CQ95604 372 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 PLK2Q9NYY3 685 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 RAMP2O60895 175 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 ECEL1O95672 775 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 NDST2P52849 883 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 AP1B1Q10567 949 aa22.62■■□□□ 1.21
PSPC1-204ENST00000492741 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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