RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492135.5

NOP56-216, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOP56, Length 1,143 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-216ENST00000492135 TIMM44O43615 452 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 HLA-EP13747 358 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ADRA1BP35368 520 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 MTA1Q13330 715 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 TRIM14Q14142 442 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 MANEALQ5VSG8 457 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 FAM72BQ86X60 149 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 FRMD1Q8N878 549 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ZNF366Q8N895 744 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 UCMAQ8WVF2 138 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 GAB3Q8WWW8 586 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ZNF653Q96CK0 615 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 TMEM245Q9H330 911 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 PARVAQ9NVD7 372 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 MPP6Q9NZW5 540 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 NEU3Q9UQ49 428 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 OR51B4Q9Y5P0 310 aa14.72□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 MFAP3LO75121 409 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 NDUFV2P19404 249 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 CNR2P34972 360 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 SDE2Q6IQ49 451 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 TMC6Q7Z403 805 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 KBTBD6Q86V97 674 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 RLN3Q8WXF3 142 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 CNPY3Q9BT09 278 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 TRIM5Q9C035 493 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 MTG2Q9H4K7 406 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 CD93Q9NPY3 652 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 TMEM51Q9NW97 253 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.71□□□□□ -0.05
NOP56-216ENST00000492135 NPC1O15118 1278 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 SRGAP2O75044 1071 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 CLDN11O75508 207 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 ALDH1A2O94788 518 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 BCKDHBP21953 392 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 PLK1P53350 603 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 COPAP53621 1224 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 CDH4P55283 916 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 DRC7Q8IY82 874 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 DCLK2Q8N568 766 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 NTAN1Q96AB6 310 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 CHP1Q99653 195 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 THAP2Q9H0W7 228 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.7□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 EPHX1P07099 455 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 MYBL1P10243 752 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 PSMA2P25787 234 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 P2RY2P41231 377 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 ZNF75DP51815 510 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 SCAPQ12770 1279 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.69□□□□□ -0.06
NOP56-216ENST00000492135 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms