RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 MYMKA6NI61 221 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 MCIDASD6RGH6 385 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 NFATC1O95644 943 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 IGKV2-30P06310 120 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 CIITAP33076 1130 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 PNLIPRP1P54315 467 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 CCDC174Q6PII3 467 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 MMP21Q8N119 569 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.67□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 KCNJ18B7U540 433 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 SEPT4O43236 478 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 CHKAP35790 457 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 PGM5Q15124 567 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 RFX8Q6ZV50 586 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 EXD3Q8N9H8 876 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 RUBCNQ92622 972 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 TASP1Q9H6P5 420 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.66□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 HMX3A6NHT5 357 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 AGAP5A6NIR3 686 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 DCTN1Q14203 1278 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 GALNTL6Q49A17 601 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 LIN54Q6MZP7 749 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 KLBQ86Z14 1044 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 NRACQ8N912 160 aa6.65□□□□□ -1.34
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USP34-216ENST00000487547 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 THSD1Q9NS62 852 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.65□□□□□ -1.34
USP34-216ENST00000487547 RHODO00212 210 aa6.64□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 PEX14O75381 377 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP34-216ENST00000487547 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP34-216ENST00000487547 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 FSIP1Q8NA03 581 aa6.64□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 CCT6BQ92526 530 aa6.64□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 FZD3Q9NPG1 666 aa6.64□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.64□□□□□ -1.35
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USP34-216ENST00000487547 H0Y3Z8 333 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP34-216ENST00000487547 MYCT1Q8N699 235 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP34-216ENST00000487547 E7EVH7 732 aa6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 TCEA3O75764 348 aa6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 SCP2P22307 547 aa6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 RRAGAQ7L523 313 aa6.62□□□□□ -1.35
USP34-216ENST00000487547 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.62□□□□□ -1.35
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