RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	LINS1	Q8NG48	757 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	REEP2	Q9BRK0	252 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CIPC	Q9C0C6	399 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	RMI1	Q9H9A7	625 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	USP29	Q9HBJ7	922 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	FZD4	Q9ULV1	537 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	VPS4A	Q9UN37	437 aa		3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036		A6NLC8	198 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	QSOX1	O00391	747 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	PRY	O14603	147 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	ACP5	P13686	325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	NDUFS1	P28331	727 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	DUSP1	P28562	367 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	GRK5	P34947	590 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	RCAN1	P53805	252 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	VAMP2	P63027	116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	MPP1	Q00013	466 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CFHR3	Q02985	330 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	RABEP1	Q15276	862 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	DLGAP5	Q15398	846 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	PCID2	Q5JVF3	399 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	RINL	Q6ZS11	566 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D5	Q92609	795 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	MARK4	Q96L34	752 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	NPAS1	Q99742	590 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	WWOX	Q9NZC7	414 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	GRM8	O00222	908 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	FYB1	O15117	783 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	JTB	O76095	146 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CD4	P01730	458 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	LYL1	P12980	280 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	ATP1A3	P13637	1013 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CHN1	P15882	459 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TNFAIP3	P21580	790 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CYP3A7	P24462	503 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	STAT6	P42226	847 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	AGTR2	P50052	363 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	NR1H2	P55055	460 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TRPC3	Q13507	836 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CBFB	Q13951	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	ATG16L1	Q676U5	607 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	DENND2C	Q68D51	928 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	WDR93	Q6P2C0	686 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	CEP85	Q6P2H3	762 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	LAS2	Q8IYD9	372 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	TERB1	Q8NA31	727 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	USP38	Q8NB14	1042 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	ARRDC3	Q96B67	414 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	PIGS	Q96S52	555 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	NOD2	Q9HC29	1040 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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